بررسي مورفولوژيكي و مولكولي نماتد Ditylenchus destructor از دامنه اصفهان

Morphological and Molecular Investigation of Ditylenchus destructor nematode from Isfahan Province

بيماري پوسيدگي غده يكي از مهم­ترين بيماري­هاي سيب زميني در جهان مي­باشد كه در سالهاي اخير اين بيماري در مزارع سيب زميني دامنه اصفهان گسترش يافته و خسارات قابل توجهي را وارد كرده است. غده­هاي آلوده شكافهاي سطحي داشته و در محل حفرات زير پوست آنها جمعيتي از يك نوع نماتد پارازيت .Ditylenchus sp حضور داشت كه با بررسي­هاي ميكروسكوپي و استفاده از كليد­هاي شناسايي معتبر، اين نماتد­ها به عنوان Ditylenchus destructor تشخيص داده شدند. با استفاده از جفت آغازگر عمومي rDNA1/rDNA2 در آزمون PCR، قطعه DNA به طول bp950 از ناحيه ITS ژنوم اين نماتد تكثير شد. بررسي الگوي برش قطعه DNA مزبور با آنزيم TaqIمشخص نمود كه DNA درتمامي نمونه ­ها از يكنواختي ژنتيكي برخوردار است. با توالي­يابي يكي از نمونه­ها و همرديف­سازي آن با توالي­هاي ثبت شده از D. destructor در بانك ژن (NCBI) مشخص شد كه توالي ژنوم نماتــد دامنه با توالي­ هاي گزارش شـده از ساير كشور­ها به ميزان %99-97 شباهت دارد. با بررسي­هاي مورفولوژيكي و مولكولي مشخص شد كه نماتد D. destructor عامل پوسيدگي غده­ هاي سيب زميني در منطقه دامنه مي ­باشد. با توجه به اهميت سيب زميني چه از نظر اقتصادي و چه ارزش غذايي اين محصول، شناسايي هر گونه عامل بيماريزاي آن مي­ تواند به بهبود كيفيت آن كمك شاياني نمايد.

Potato tuber rot is a common and important disease in the world that has been recently occurred in potato fields of Damaneh in Isfahan province. Skins of the infected tubers are usually cracked containing Ditylenchus sp. parasite nematodes in tuber flesh. Using microscopic examination and valid keys of the specimen was identified as Ditylenchus destructor nematode. Molecular identification with PCR using general primer rDNA1/rDNA2 yielded a 950 bp DNA fragment corresponding to ITS region of the nematode samples. The TaqI digestion of fragment revealed the genetic homology among ITS region of the strains of D. destructor collected from Damaneh. Sequence analysis of this fragment and its alignment with the sequences deposited in NCBI database indicated that the ITS sequence of the nematode isolate from Damaneh has significant homology (97- 99%) with the sequences of D. destructor reported from other countries. Based on morphological and molecular tests, D. destructor was identified as the cause of potato tuber rot in this region. it had sever damages on the potato fields. Regarding the economical and nutritional importance of potato, identification of any pathogen can help in improving the quality of this product.