عنوان مقاله :
بررسي ويروس پيچيدگي برگ زرد گوجه فرنگي در استان بوشهر
عنوان به زبان ديگر :
Evaluation of Tomato Yellow Leaf Curl Virus in Bushehr Province
پديد آورندگان :
ايازپور، كاوس دانشگاه آزاد اسلامي واحد جهرم - گروه بيماري شناسي گياهي، جهرم، ايران , زيارتي، طاهره دانشگاه آزاد اسلامي واحد جهرم - گروه بيماري شناسي گياهي، جهرم، ايران
كليدواژه :
استخراج دي ان اي , مگا 6 , توالي يابي , آناليز فيلوژنتيكي , بوشهر
چكيده فارسي :
گوجهفرنگي يكي از سبزيجات مهم و بيماري پيچيدگي برگ زرد گوجهفرنگي از مهمترين بيماريهاي گوجهفرنگي در سراسر دنياست. طي فصلهاي زمستان 1391 و بهار 1392، به منظور بررسي ويروس پيچيدگي برگ زرد گوجه فرنگي در استان بوشهر از مزارع كشت گوجه فرنگي واقع در شهرستانهاي تنگ ارم، دشتستان و چند بخش مربوط به آن از گياهان مشكوك به آلودگي نمونه برداري شد. پس از استخراج DNA، واكنش زنجيره اي پليمراز با استفاده از آغازگرهاي sense و antisense منجر به تكثير قطعهاي با اندازه تقريبي550 جفت باز از ژن پروتئين پوششي و حركتي ويروس شد. محصول واكنش زنجيره اي پلي مراز متعلق به سه جدايه، براي تعيين ترادف انتخاب و به كره ارسال شدند. ژنهاي توالي يابي شده در بانك ژن جهاني ثبت گرديدند. تجزيه داده ها نيز به دنبال همرديف سازي آنها با بانك ژن جهاني با استفاده از نرم افزار clustalw انجام و درخت فيلوژنتيكي حاصل با نرم افزار mega6 با 1000 bootstrap ترسيم گرديد. آناليز هاي فيلوژنتيكي نشان داد كه جدايههاي مورد بررسي در دو گروه جداگانه A و B قرار گرفتند. در اين تقسيم بندي در گروه A جدايه هاي دشتستان (KP635447) و تنگ ارم (KP635448) به جدايه هاي مورد بررسي در كشورهاي ديگر از جمله چين (AY594194) و ونزوئلا (EF625895) و به جدايه هاي مورد بررسي در داخل كشور از جمله شيراز (GU076444) و تهران (KC106648، KC582150) نزديك بودند. در گروه B جدايهاي ديگر از دشتستان (KP635446) به جدايههاي كشورهاي عربي از جمله عربستان (HM590558)، عمان (KF229721، KF229725) و به جدايه داخلي جيرفت (GU076450) نزديك ميباشد. نتايج حاصل نشان ميدهد كه ويروس پيچيدگي برگ زرد گوجه فرنگي در ايران و همچنين در يك منطقه (دشتستان) داراي تنوع ژنتيكي بوده و براي تعيين وجود نژادهاي نوتركيب جديد نياز به تحقيقات بيشتري بر روي جدايه هاي ايراني ميباشد. همچنين علائم متفاوتي با توجه به نوع رقم ميزبان، منطقه جمع آوري نمونه و همچنين آلوده شدن گياه در زمان هاي متفاوت ايجاد مي كنند.
چكيده لاتين :
Tomato is one of the most important vegetables and Tomato Yellow Leaf Curl Virus (TYLCV) is one of the most important viral disease of tomato in worldwide. In order to study the situation of TYLCV in Bushehr province, sampling of tomato plants with symptoms of virus was done during winter and spring of 2013. Samples were collected from farms of Tang Eram and Dashtestan areas. After DNA extraction , a part of coat protein gene (about 550 pb) was amplified using specific primers. Amplified segments were separated via electrophoresis and sequenced. For comparison and phylogenetic analysis, the sequences Blasted in Gene bank and using CLUSTALW and Mega4 software the phylogenetic tree was drawn via maximum parsimony method. TYLCV Phylogenetic analysis showed that all isolates were divided into two clades named as A and B. In clade A isolates of Dashtestan (KP635447) and Tang Eram (KP635448) were closed to isolates of China (AY594194) and Venezuela (EF625895) and some Iranian isolates including GU076444 from (Shiraz), KC106648 and KC 582150 from (Tehran). In clade B another isolates of this study from Dashtestan was closed to Arabic countries isolates including HM590558 from Saudi Arabia, KF229721 and KF229725 from Ammanand Iranian isolates of GU076450 from Jirof. Results showed variation among Bushehr province. Due to the results of this study can conclude that there is variation among isolates of Bushehr province and requires further studies on the existence of recombinant strains in Iranian samples.
عنوان نشريه :
تحقيقات نوين در گياه پزشكي