پراكنش ويروس واي سيب زميني (Potato Virus Y) در شهرستان جهرم

Distribiution of Potato Virus Y in Jahrom area

به منظور بررسي ويروس واي سيب زميني از مزارع مختلف خانواده سيب زميني از قبيل سيب زميني، گوجه فرنگي، بادنجان و تنباكو در منطقه جهرم، طي فصول بهار و تابستان سال هاي 1391 و 1392 تعداد 350 نمونه گياهي با علايم موزاييك و زردي برگ ها، لكه هاي نكروتيك روي رگبرگ ها و كوتولگي جمع آوري شد. بررسي آلودگي نمونه ها با آزمون سرولوژيكي اليزا و آزمون مولكولي RT-PCR انجام گرديد. در بررسي نمونه هاي مشكوك با آزمون سرولوژيكي DAS-ELISA با استفاده از آنتي سرم پلي كلونال ويروس واي سيب زميني، تعداد 60 نمونه كه تنها از سيب زميني بودند آلوده به ويروس تشخيص داده شدند. براي تشخيص ويروس در آزمون RT-PCR از جفت آغازگرهاي P1 و P2 كه ژنوم پوشش پروتييني ويروس را تكثير مي كردند، استفاده شد. در نهايت دو نمونه مورد بررسي كه در محدوه 1000 جفت بازي ايجاد باند كرده بودند ترادف يابي گرديد. نتايج نشان داد كه از بين گياهان مورد بررسي، آلودگي فقط در سيب زميني ديده مي شود و گياهان ديگر، عاري از آلودگي به PVY بودند. مقايسه توالي نوكليوتيدي پوشش پروتييني دو جدايه با 19 توالي نوكليوتيدي PVY موجود در بانك ژن جهاني نشان داد كه يكي از جدايه هاي جهرم با بيشتر جدايه هاي اروپايي در گروه الف و جدايه ديگري با تعدادي معدود در گروه ب قرار مي گيرند. بنابراين آلودگي به اين ويروس فقط در گياهان سيب زميني در اين منطقه مشاهده شد كه احتمالا حاصل استفاده از غده هاي بذري آلوده مي باشند. اين اولين گزارش از حضور آشكار ويروس واي سيب زميني و نژاد NTN آن در منطقه جهرم و استان فارس مي باشد.

In this study three hundred fifty samples collected from diseased potato, tomato and eggplant plants that showed virus suspected symptoms such as: mosaic and yellowing of leaves, necrotic spots on veins and stunting from Jahrom region of Fars province. The samples were detected by using enzyme linked immunosorbent assay (DAS-ELISA) method with polyclonal antibodies for serological distinguishing of Potato Virus Y (PVY). Almost sixty samples collected from potato were infected by PVY in this phase. For molecular diagnostic of the virus, RT-PCR assay were used for infected samples with primer pairs of P1 and P2. These primers could amplify the coat protein region of virus genome. Eventually PCR products of two samples were sequenced and compared with 19 sequences available in GenBank using Blast search. The MEGA6 software and UPGMA method were used to draw phylogenetic tree. The drawn tree showed that the isolates of jahrom-Iran and the most isolates of Europe were placed in separate clusters.This results showed that in this area, virus infected only found in potato plants so it is possible that crop infections were related to use of infected seed tubers. This is the first report of in Jahrom area.