بررسي ارتباط فيلوژنتيكي جدايه‌هاي ويروس كوتولگي سبزرد هندوانه (WmCSV) استان سيستان و بلوچستان بر اساس توالي ژن رمز كننده پروتئين پوششي

ويروس كوتولگي سبزرد هندوانه (Watermelon chlorotic stunt virus, WmCSV) به جنس Begomovirus از خانواده Geminiviridae تعلق دارد كه بيشترين تعداد گونه را در مقايسه با ساير جنس هاي آلوده كننده گياهان در خانواده Geminiviridae دارد و از طريق سفيد بالك منتقل مي شود. به منظور شناسايي و بررسي تنوع ژنتيكي WmCSV در محصولات كدوييان جنوب شرق كشور در سال هاي 95 و 96 بازديدهايي از مزارع شهرستان هاي زابل، زهك، هامون، هيرمند، نيمروز، زاهدان، سراوان، ايرانشهر، نيك شهر، سرباز، كنارك و چابهار در استان سيستان و بلوچستان انجام گرفت و از محصولات مختلف كدوييان شامل خربزه، طالبي، هندوانه، كدو مسمايي و حلوايي نمونه برداري شد. از گياهان داراي نشانه‌هاي زردي رگبرگ، كوتولگي گياه، سبزردي و پيسكي شدن برگ ها، بدشكلي شديد و كوچك شدن اندازه ميوه نمونه برداري شد و نمونه ها به آزمايشگاه منتقل شدند و سپس استخراج دي ان اي كل گياه انجام شد. جهت شناسايي WmCSV از آغازگرهاي اختصاصي GemCPV5’ و GemCPV3’ شناسايي كننده جنس بگوموويروس در كدوييان استفاده شد. محصولات پي سي آر مورد انتظار، به طول 550 جفت باز از ژن رمزكننده پروتئين پوششي، مورد توالي يابي قرار گرفتند. نتايج تعيين توالي مربوط به 16 نمونه از محصولات پي سي آر متعلق به مناطق مختلف استان آلودگي نمونه ها را به WmCSV تأييد كرد. آناليز فيلوژنتيكي نتايج  توالي يابي، در اين پژوهش با برنامه MEGA 5، جدايه هاي WmCSV از استان سيستان و بلوچستان را در دو گروه مجزا تفكيك كرد. نتايج نشان داد كه اين گروه بندي ارتباطي با نوع ميزبان و يا منطقه جغرافيايي نداشته و برخي جدايه هاي استان ارتباط نزديكي با جدايه هاي كشورهاي عمان و عربستان داشتند.