بررسي و مقايسه ميزان تغييرات نابجاي متيلاسيون توالي DNA پروموتوري ژن TLR4 در بيماران مبتلا به بيماري التهابي روده و افراد سالم

Evaluation and Comparison of Aberrant Methylation Changes in Tlr4 Gene Promoter DNA Sequencing in Patients with Inflammatory Bowel Disease and Healthy Individuals

زمينه و هدف شيوع بيماري هاي التهابي روده با توجه به گزارش هاي وزارت بهداشت ايران رو به افزايش است. نقش عملكردي ژن TLR4 به عنوان واسطه پاسخ هاي ايمني ذاتي به ميكروب هاي بيماري زاي دستگاه گوارش و ارتباط آن با تغييرات اپي ژنتيك در پاتوژنز اين بيماري داراي اهميت است. هدف ما بررسي تغييرات نابجاي متيلاسيون توالي DNAپروموتوري ژن TLR4در بيماران التهابي روده و ارزيابي اين ژن به عنوان يك بيوماركر جهت تشخيص در اين بيماري است. مواد و روش ها: اين مطالعه تجربي، از نوع مورد-شاهدي بر روي DNA استخراج شده از خون محيطي 35 بيمار مبتلا به بيماري هاي التهابي روده و 20 فرد سالم به عنوان كنترل انجام گرفت. به منظور بررسي تغييرات متيلاسيون پروموتر توالي DNA ژن TLR4 در بيماران مبتلا به بيماري التهابي روده و افراد سالم از تكنيك (HRM) High resolution melting استفاده شد. نتايج طبق يافته هاي حاصل از اين مطالعه، تجزيه وتحليل سطح متيلاسيون نواحي CPG پروموتور ژن TLR4، اختلاف آماري معني داري در مقايسه بين 35 بيمار التهابي روده و 20 فرد سالم نشان نداد (525/0=p). همچنين در اين مطالعه تغييرات متيلاسيون در ارتباط با ويژگي هاي كلينيكوپاتولوژيك انجام شد كه ارتباط معناداري مشاهده نگرديد. در مقايسه بين سطح متيلاسيون در قوم فارس نسبت به ساير قوم هاي كرد، لر، ترك، گيلاني، عرب، مازندراني و افغان ارتباط معنادار مشاهده گرديد (035/0=p). نتيجه گيري: اين مطالعه نشان داد كه ارتباط معني داري از مقايسه سطح متيلاسيون توالي پروموتوري ژن TLR4 در خون بين بيماران التهابي روده و افراد سالم وجود ندارد، لذا متيلاسيون توالي پروموتوري ژن TLR4 ماركري اختصاصي در خون محيطي جهت تشخيص و درمان بيماري التهابي روده نيست.

Background & Objective: According to the Iranian Ministry of Health prevalence of registeridentified inflammatory bowel disease among Iranian patients increased. The functional role of the TLR4 gene as a mediator of innate immune responses to pathogenic microbes in the gastrointestinal tract and its relationship to epigenetic changes is important. Our goal is to investigate the promoter DNA methylation of TLR4 gene in inflammatory bowel disease and to evaluate TLR4 gene as a biomarker to diagnose the disease. Materials & Methods: In this case-control study, DNA was extracted from peripheral blood of 55 volunteers including 35 patients with IBD and 20 healthy controls. High resolution melting technique (HRM) was used to investigate the promoter methylation changes of TLR4 DNA sequence in patients with inflammatory bowel disease and healthy controls. Results: According to the results of this study, methylation level analysis of CpG regions of TLR4 promoter showed no significant difference between 35 inflammatory bowel patients and 20 healthy individuals (P = 0.525). Also in this study, methylation changes were performed in relation to clinicopathological features that no significant relationship was observed. A significant assocation was observed between the levels of methylation in Fars compared to other ethnic groups such as Kurdish, Lor, Turk, Gilani, Arab, Mazandaran and Afghan (= 0.035 P Value). Conclusion: This study showed that there is no significant relationship between the level of promoter methylation of TLR4 gene in the blood of patients with inflammatory bowel disease and healthy individuals.