ارزيابي تنوع ژنتيكي بين و درون گونه‌اي چاودار با استفاده از نشانگر مولكولي AFLP

چاودار يكي از گياهان زراعي مهم ايران با نام علمي Secaleمتعلق به خانواده گندميان (Poaceae) مي باشد. در اين پژوهش تنوع ژنتيكي 39 جمعيت چاودار از مناطق مختلف ايران، آمريكا و روسيه با نشانگر AFLP مورد ارزيابي قرار گرفت. نتايج بدست آمده نشان داد كه 13 جفت آغازگر AFLP 188 باند توليد كردند كه شامل 177 باند چندشكل بود. ميانگين ميزان اطلاعات چندشكلي (PIC) و شاخص نشانگر (MI) در جفت آغازگرهاي AFLP به ترتيب معادل 0.22 و 3 عدد بود. بيشترين مقدار PIC مربوط به جفت آغازگر ECC 3N 4S 1 و بيشترين MI مربوط به جفت آغازگر ECC 3N 4S 5 بود. پس از مشاهده محصول هاي واكنش زنجيره اي پليمراز بر روي ژل پلي اكريل آميد و امتيازدهي باندهاي DNA، تجزيه و تحليل با نرم افزار NTSYS انجام شد. دندروگرام تجزيه خوشه اي با روش UPGMA و ضريب تشابه دايس جمعيت هاي چاودار را به پنج گروه تقسيم كرد كه گروه بندي آن با گروه بندي تجزيه مولفه هاي اصلي مطابقت داشت. نتايج تجزيه واريانس مولكولي بيانگر تنوع درون گونه اي بيشتر از تنوع بين گونه اي بود. و ميانگين شاخص شانون (I) در گونه هاي چاودار 0.48 بود كه بيانگر تنوع نسبتاً خوب درون گونه ها مي باشد. نتايج نشان داد كه نشانگر AFLP ابزار مفيدي در تعيين تنوع ژنتيكي درون و بين گونه اي چاودار است.