عنوان مقاله :
توالي‌يابي نسل جديد و برهمكنش‌هاي ذاتي ويروس-ويروس و ويروس-گياه
پديد آورندگان :
دهقانپور فراشاه ، سعيده دانشگاه پيام نور مركز تهران - گروه كشاورزي , صالح زاده ، مهرداد دانشگاه شيراز - دانشكده‌ي كشاورزي , اشرفي ، احمد دانشگاه آزاد اسلامي واحد ملكان - دانشكده‌ي كشاورزي
كليدواژه :
اكولوژي , ترانسكريپتوم , خاموشي آر.ان.اِ , RNA-Seq
چكيده فارسي :
براي درك اكولوژي ويروس ها، لازم است تا اطلاعات جامع در خصوص برهمكنش هاي ويروس-ويروس و ويروس-ميزبان در سيستم هاي طبيعي به دست آيد. در اين مطالعه، مشخص شده است كه فناوري توالي يابي آر.ان.اي (RNA-Seq)، امكان اين تحليل را بدون مفروضات قبلي در خصوص آلودگي ها و علائم ويروسي يا ژن هاي ميزبان فراهم مي كند. توالي يابي نسل جديد امكان شناسايي بالقوه ي آلودگي هاي چندگانه را تسهيل مي كند. پاسخ هاي ضد ويروسي ميزبان به واسطه خاموشي آر.ان.اِ، تحت شرايط طبيعي اتفاق مي افتد. از آنجايي كه تحقيقات درزمينه ويروس هاي گياهي به طور عمده بر بيماري هاي گياهان زراعي متمركز بوده اند، اطلاعات كمي در خصوص اين ويروس ها در محيط هاي طبيعي وجود دارد. توالي يابي آر.ان.اِ در گياهان مربوط به يك جمعيت طبيعي براي تعيين هم زمان حضور و عدم حضور همه ي ويروس هايي كه توالي آن ها گزارش شده است، شناسايي ويروس هاي جديد و سنجش كمّي ترانسكريپتوم ميزبان مورد استفاده قرار مي گيرد. با معرفي معيارهاي تعداد خوانش و پوشش ژنوم، آلودگي هاي ناشي از ويروس آشكار شده و برهمكنش هاي ذاتي و پنهان گياهويروس مي تواند كاربردهاي مهمي در كنترل اين عوامل بيماري زا داشته باشد.
عنوان نشريه :
ايمني زيستي
عنوان نشريه :
ايمني زيستي
