بررسي بيوانفورماتيكي پروتئين همولوگ شوك حرارتي جدايه‌هاي ايراني ويروس زردي كلروتيك كدوئيان (Cucurbit chlorotic yellows virus) در افزايش تفاوت ژنتيكي

پروتئين شوك حرارتي در كلستروويروس‌ها نقش هاي متعددي به‌ويژه حركت سلول به سلول را براي ايجاد آلودگي سيستميك بر عهده دارد. در پژوهش حاضر، تفاوت ژنتيكي ژن همولوگ پروتئين شوك حرارتي (HSP70h) جدايه‌هاي ايراني ويروس زردي كلروتيك كدوئيان و همچنين فشار انتخاب وارد شده بر آن ها بررسي شد .به اين منظور تعداد 195 نمونه با علايم زردي، كوتولگي و بدشكلي برگ ها از مزارع كدوئيان استان سيستان و بلوچستان جمع‌آوري و با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي، از منطقه ژنتيكي پروتئين همولوگ شوك حرارتي ويروسCCYV قطعه‌اي به‌طول 462 جفت‌باز براي 15 نمونه توسط روش RT-PCR تكثيرشد و 7 جدايه مورد بررسي فيلوژنتيكي قرار گرفت. نتايج به‌دست آمده نشانگر آلودگي 7 درصد نمونه‌ها به ويروس زردي كلروتيك كدوئيان در مناطق مورد بررسي بود. آناليزفيلوژني توالي‌هاي نوكلئوتيدي و اسيد آمينه‌اي جدايه‌هاي CCYV را به دو گروه ايراني و شرق آسيا تقسيم نمود و جدايه‌هاي سيستان و بلوچستان در دو شاخه مجزا قرارگرفتند. هم‌رديفي توالي اسيدآمينه فرضي پروتئين همولوگ شوك حرارتي و مطالعات فشار انتخاب بر روي 7 جدايه موجود در تحقيق با 3 جدايه ايراني و جدايه هاي خارجي اين ويروس نشان داد كه ژن HSP70h در جدايه هاي ايراني و ساير جدايه هاي اين ويروس تحت فشار انتخاب مثبت در كدون 82 قرار دارند كه منجر به تغيير يك اسيد نوكلئيك (CTC به TTC) به‌ترتيب براي جدايه‌هاي مركزي و جدايه هاي زابل، هيرمند و نيمروز در موقعيت 244 شده و اسيد آمينه لوسين به فنيل آلانين در پروتئين همولوگ شوك حرارتي تغيير نموده است. نتايج نشان‌دهنده وجود جدايه‌هاي متنوع ويروس CCYV در كشور بوده و تفاوت در توالي نوكلئوتيدي و اسيدآمينه‌اي مي‌تواند حاكي از تفاوت در منشا ميزباني باشد بنابراين فشار انتخاب در تنوع ژنتيكي جدايه‌ها دخالت داشته است.