شناسايي جهش فقدان عملكرد p.Q579X موثر بر سقط جنين در ژن APAF1در گاوهاي هلشتاين

امروزه مشكلات توليد مثلي يكي از نگراني هاي اصلي در صنعت گاو شيري است. هدف از پژوهش حاضر شناسايي جهش فقدان عملكرد p.Q579X موثر بر سقط جنين خود به خودي و مشكلات توليد مثلي در ژن APAF1 با روش توالي يابي در گاو هلشتاين بود. در مجموع 200 نمونه خون تهيه و استخراج DNA با كيت تجاري انجام شد. سپس يك جفت آغازگر اختصاصي براي تكثير قطعه اي با طول 456 جفت باز حاوي جهش مورد نظر طراحي و تعيين ژنوتيپ نمونه ها با روش PCRSSCP انجام شد. در جايگاه APAF1 دو آلل A و B و دو ژنوتيپ AA و AB به ترتيب با فراواني هاي 96/76، 3/24، 93/51 و 6/49 درصد مشاهده شدند. ژنوتيپ BB در نمونه هاي مورد مطالعه مشاهده نشد. بعد از تعيين ژنوتيپ نمونه ها، از هر ژنوتيپ دو نمونه به صورت دو طرفه توالي يابي شده و بعد از هم ترازي توالي هاي به دست آمده، مقايسه آن ها با توالي رفرنس براي شناسايي جهش هاي مورد نظر با استفاده از نرم افزار BioEdit (version7.0.9.0 ) صورت گرفت. نتايج بررسي هاي بيوانفورماتيك نشان داد كه جهش p.Q579X كه يكي از جهش هاي موثر بر سقط جنين در گاو هلشتاين مي باشد در ژنوتيپ AB ژن APAF1 در گاوهاي هلشتاين در ايران وجود دارد. با توجه به اينكه اين جهش در حالت هموزيگوت باعث سقط جنين در گاو مي شود، مي توان نتايج حاصل از اين پژوهش را در برنامه هاي اصلاح نژادي در راستاي شناسايي حاملين و حذف آن ها از گله گاوهاي شيري هلشتاين به كار برد.