ارزيابي بيوانفورماتيكي تأثير تركيبات گياهي موجود در گياهان دارويي Hyssopus officinalis L. ، Tragopogon graminifolius و Avicennia marina L. در مهار پروتئين‌هاي مؤثر در بروز مقاومت آنتي‌بيوتيكي در Acinetobacter baumannii

هدف: استينوباكتر بوماني باكتري مهمي در ايجاد عفونت هاي بيمارستاني مي باشد كه مقاومت چند دارويي دارد. چندين عامل در مقاوم شدن اين باكتري ها در برابر داروها نقش دارند كه مهم ترين آن ها پروتئين هاي OXA24 betalactamase، OXA23 betalactamase وOUTER MEMBRANE PROTEIN A (OMPA)  هستند. در همين راستا هدف از اين مطالعه بررسي اثر مهاركنندگي تركيبات گياهي موجود در گياهان دارويي شنگ، زوفا و مانگرو بر اين پروتئين هاي استينوباكتر در محيط in silico مي باشد. مواد و روش‌ها: در اين پژوهش نخست ساختار تركيبات گياهي  و پروتئين هاي مورد بررسي به ترتيب از پايگاه هاي  PubChem  و PDB دريافت و سپس خصوصيات فيزيكوشيميايي تركيبات گياهي و همين طور پتانسيل جهش زايي آن ها به ترتيب توسط سرور Swiss ADME  و نرم افزار Toxtreev2.6.13 پيش بيني شدند. براي انجام داكينگ مولكولي و برهمكنش ميان تركيبات گياهي و پروتئين هاي مورد نظر از محيط هاي ViewerLite، Chimera 1.14، Discovery Studio ، AutoDockTools1.5.6  و AutoDock Vina استفاده شد. در نهايت، نتايج با استفاده از سه برنامه AutoDockTools ،Visualizer DS و Ligplot مورد آناليز قرار گرفت. نتايج: پتانسيل جهش زايي و مهار سيتوكروم ها نشان دادند تركيبات مربوط به H. officinalis پتانسيل جهش زايي و سميت سلولي بالاتري نسبت به دو گياه ديگر داشتند. علاوه بر اين، نتايج نشان داد كه تركيبات گياهي A. marina  جذب گوارشي بالاتري در مقايسه با ساير تركيبات دارند. بررسي مقايسه اي برهمكنش ها نشان داد كه تركيبات گياه H. officinalis و A. marina  برهمكنش هاي قوي تري را با پروتئين هاي مورد بررسي انجام مي دهند. علاوه بر اين مشخص شد قوي ترين برهمكنش هاي رخ داده بين تركيبات گياهي و پروتئين 1BXWمي باشد. از طرف ديگر مشخص شد تركيبات گياه T. graminifolius برهمكنش هاي ضعيف تري را با پروتئين هاي مورد ارزيابي ايجاد مي كنند. نتيجه‌گيري: بر اساس نتايج به دست آمده از مطالعات داكينگ، در ميان تمام تركيبات مورد ارزيابي در هر سه پروتئين 1BXW، 3G4P و4K0X ، بهترين نتايج داكينگ مربوط به تركيبات cispinocamphone و3,5difluorophenyl ester 2,6difluorobenzoic acid به ترتيب از گياهان زوفا و مانگرو است. در حقيقت اين تركيبات با منفي ترين سطح انرژي اتصال (به ترتيب  Kcal/mol9 و 8.8) تمايل بيشتري براي اتصال به آمينواسيدهاي كليدي جايگاه فعال هر سه پروتئين مورد مطالعه دارد. بنابراين تركيبات مذكور مي توانند به عنوان نامزدهاي بسيار مناسبي براي بررسي آزمايشگاهي و in vivo فعاليت ضد A. baumannii محسوب شوند.