بررسي شاخص‌هاي تنوع ژنتيكي در يك جمعيت از گاو هلشتاين با استفاده از نشانگرهاي متراكم اسنيپ

كاهش ميزان تنوع ژنتيكي و به تبع آن افزايش تجمعي ميزان هم خوني از جمله عوامل تهديد كننده صنعت پرورش گاو شيري محسوب مي شوند. هدف از پژوهش حاضر، ارزيابي شاخص هاي تنوع ژنتيكي (توزيع عدم تعادل لينكاژي، آماره هتروزيگوتي مشاهده شده و مورد انتظار، آماره Fis، توزيع فراواني آلل هاي نادر، ميزان اتوزيگوتي و تجزيه به مؤلفه هاي اصلي) در گاو هلشتاين با استفاده از نشانگرهاي متراكم اسنيپ بود. داده هاي ژنوتيپي متعلق به 25 گاو ماده هلشتاين حاصل از تراشه اسنيپ گاوي 50 هزارتايي، اهدايي از شركت تجاري آلتادلتا ژنتيك تجزيه و تحليل شد. محاسبات آماري شاخص هاي مولكولي مذكور از طريق نرم افزار معروف پلينك، نسخه 1/9تحت محيط R صورت گرفت. ميانگين فراواني آلل نادر (0/28)، ميانگين فراواني هتروزيگوتي مشاهده شده و هتروزيگوتي مورد انتظار به ترتيب (0/38، 0/37)، آماره شاخص تثبيت (Fis) (منفي0/032)، آماره Fhom(0/0328-) اندازه گيري شد. همچنين، نتايج تجزيه به مؤلفه هاي اصلي، تنوع و پراكنش معني دار بالايي را نشان داد كه تأييدي بر مطابقت و هم خواني همه آماره هاي مولكولي اندازه گيري شده و بالا بودن ميزان تنوع ژنتيكي اندازه گيري شده بود. از آنجايي كه، شاخص ROH، از اطلاعات توالي نوكلئوتيدي يكسان انتقال يافته به دو فرد حاصل مي شود لذا، در مقايسه با شاخص Fis، معيار آماري مناسب تري براي مطالعه ميزان هم خوني، مي باشد. نتيجه گيري نهايي اين كه، بكارگيري نشانگرهاي متراكم اسنپ مي تواند، ابزاري مناسب براي ارزيابي وضعيت تنوع ژنتيكي و هم خوني جمعيت هاي دامي محسوب شود.