شناسايي رونوشت هاي با بيان افتراقي در گندم نان تحت تنش شوري با استفاده از تكنيك cDNA-AFLP

شوري يكي از مهمترين شرايط نامطلوب محيطي است كه منجر به از بين رفتن بخشي از عملكرد گندم مي ­شود. لذا شناخت ژن­هايي با بيان افتراقي و آگاهي از عملكرد آنها در گندم براي افزايش مقاومت به شوري ضروري است. براي تعيين ژن­هاي پاسخ دهنده به شوري، ترانسكريپتوم گندم شاهد و تحت تنش از طريق تكنيك cDNA-AFLP مورد ارزيابي قرار گرفت. بر مبناي مشاهدات ما، 31 قطعه حاصل از ترانسكريپت (TDF) با موفقيت توالي ­يابي شدند. بيشتر TDFهاي شناخته ­شده به كمك جستجوي BLASTX، متعلق به ژن­هاي درگير در گروه­ هاي مختلف عملكردي مانند انتقال، تجزيه پروتئين، تنظيم رونويسي، انتقال سيگنال، دفاع سلول، انرژي و متابوليسم بودند. تكنيك PCR زمان­واقعي نشان داد كه بيان چهار TDF كم شد درحاليكه بيان 18 TPF افزايش يافت. به طور كلي، اين يافته­ ها درك ما از مكانيسم ­هاي سلولي دخيل در پاسخ گندم به شوري خاك را ارتقاء بخشيد. علاوه بر اين، شناسايي ژن­هاي جديد پاسخ ­دهنده به تنش شوري اطلاعات مفيدي براي كمك به بهبود تحمل گندم به اين تنش را در مزرعه ارائه مي­ دهد.

Salinity stress is one of the unfavorable environmental conditions leading to loss of yield in wheat. Therefore, the discovery of differentially activated transcripts and understanding of their role in the salinity-treated wheat are indispensable for improving salt resistance. To explore the salinity-responsive genes, we assayed transcripts from salt-stressed and control wheat by using cDNA-AFLP approach. Based our observations, 31 transcript-derived fragments (TDFs) were successfully sequenced. BLASTX search revealed that most of the TDFs were belonged to the genes responsible for metabolism and energy, cell defense, transcription control, transport, signal transduction, and protein degradation functional groups. Real-time polymerase chain reaction displayed that 18 TDFs up-regulated and four down-regulated under salinity. Overall, these findings can enhance our understanding on the molecular mechanisms of salt response in wheat. Besides, the identification of novel salinity-responsive genes can represent important information, which in turn, assists the improvement of wheat tolerance to this stress in the field.