تجزيه تحليل فيلوژنتيك ژن ND6 ژنوم ميتوكندري در مرغ بومي سيستان و بلوچستان

امروزه ژن‌هاي موجود در ژنوم ميتوكندريايي به عنوان نشانگر ژنتيكي قوي به صورت گسترده كاربرد دارند. هدف از اين مطالعه، توالي‌يابي ناحيه ND6 ژنوم ميتوكندري مرغ خزك و بررسي رابطه فيلوژنتيكي اين ناحيه از مرغ بومي خزك با ديگر نژاد‌هاي مرغ و برخي از ماكيان بود. براي اين منظور نمونه خون از وريد بال 20 قطعه مرغ خزك از پژوهشكده دام‌هاي خاص استان سيستان و بلوچستان جمع‌آوري شد. استخراج DNA از خون كامل انجام گرفت. سپس ژن ND6 به همراه بخشي از tRNA بالادست و پايين دست (854 جفت باز) توسط آغازگرهاي اختصاصي در واكنش زنجيره‌اي پليمراز تكثير شد. نمونه‌ها پس از خالص‌سازي توالي‌يابي شدند و تنوع ژنتيكي درون جمعيتي مورد بررسي قرار گرفت. در ادمه، پس از گرفتن 19 توالي مشابه ژنوم ميتوكندريايي مربوط به ساير نژادهاي مرغ و برخي از ماكيان از بانك جهاني ژن، تجزيه و تحليل فيلوژنتيك انجام گرفت. نتايج بدست آمده نشان داد كه هيچ تفاوت نوكلئوتيدي بين توالي‌هاي نوكلئوتيدي ND6 مرغ‌هاي بومي خزك وجود نداشت. نتايج حاصل از رسم درخت فيلوژنتيك مرغ بومي خزك با ديگر نژادها نشان داد كه بيشترين تشابه ژنتيكي اين ناحيه از ژنوم ميتوكندري مرغ خزك با نژاد مرغ‌هاي هوانگ لانگ، ژوسيانگ، فيجي، فليپين، هانگشان زرد، جينو ووفنگ، مرغ جنگلي قرمز و مرغ اهلي مشاهده مي‌شود. نتايج نشان دهنده قرابت ژنتيكي زياد بين مرغ بومي خزك با مرغ‌هاي ژاپن و چين (جنوب شرقي آسيا) مي‌باشد. كمترين تشابه ژنتيكي اين ناحيه از مرغ بومي خزك با پرنده ماهي خوار تاج قرمز مشاهده شد.