برآورد هم خوني ژنومي و ارزيابي هموزيگوسيتي ايجاد شده در گاوهاي سرابي و نجدي

مطالعه حاضر به منظور برآورد سطح هم‌خوني ژنومي با استفاده از تجزيه (FROH) ROH در دو توده گاو بومي ايران شامل سرابي و نجدي و همچنين مقايسه برآوردهاي FROH با ديگر برآوردهاي ضريب هم‌خوني بر اساس ماتريس رابطه ژنوم (FGRM)، درصد SNPs هموزيگوت (FHOM) و اطلاعات شجره‌نامه (FPed) انجام شد. براي انجام اين كار، به ترتيب تعداد 213 و 211 نمونه به طور تصادفي از جمعيت سرابي و نجدي انتخاب شدند. نمونه‌ها با استفاده از ريز‌ تراشه Illumina BeadChip 40K v2 تعيين ژنوتيپ شدند. علاوه بر اين، تعداد 30 نمونه از گاوهاي شيري هلشتاين ايران از مركز اصلاح نژاد ايران، مورد بررسي قرارگرفتند. آناليز ژنومي با استفاده از برنامه‌هاي CFC ، Excel، Plink، SNeP انجام شد. در مجموع 2030 بلوك هاپلوتيپي در جمعيت شناسايي شدند. بيشترين و كمترين تعداد قطعات (ROHs) ROH در بين جمعيت نجدي و سرابي مشاهده شد. علاوه بر اين، طول ROH در بين نژادهاي مختلف متفاوت بود (0/05 p). جمعيت نجدي بيشترين تعداد ROH را در دسته‌هاي با طول متفاوت Mb ) ROH84، Mb168 وMb 16 ) داشتند. حداكثر ضريب همبستگي بين ضرايب هم‌خوني برآورد شده بين FPed و FROH 4Mb (0.592) در جمعيت سرابي بدست آمد (0/001 p ). نتايج اين مطالعه وجود هم‌خوني، حداقل در پنج نسل اخير جمعيت بومي مورد مطالعه را نشان مي‌دهد و برنامه‌هاي حفاظتي بايد به منظور مديريت سطوح هم‌خوني در هر دو جمعيت صورت گيرد.