استخراج و توالي‌يابي ژن هم‌ساخت Flowering locus T (FT) در شاهي (Lepidium sativum L.): بررسي فيلوژنتيكي پروتئين استنباطي آن

Isolation and Sequencing of Flowering locus T (FT) homologous gene in Lepidium sativum L.: a Phylogeny study of its deduced protein

گذر به گل‌دهي، يك تغيير فاز اصلي در چرخه‌ي زندگي گياهان است. ژن Flowering locus T (FT)، به عنوان ژن هدف مسير فتوپريود، گل‌دهي را تحريك مي‌كند. پروتئين FT، از اجزاي اصلي هورمون گلدهي (فلوريژن) است. اين پژوهش با هدف شناسايي و تعيين توالي اين ژن در گياه شاهي (Lepidium sativum L.) انجام شد. RNA كل از برگ جوان گياه در مرحله‌ي زايشي، استخراج و براي ساخت cDNA استفاده گرديد. آغازگر‌هاي اختصاصي بر اساس توالي‌ ژن‌هاي همساخت FT در گياهان هم خانواده، طراحي و براي واكنش ‌RT-PCR استفاده گرديد. محصول اين واكنش پس از خالص سازي، توالي يابي شد. نتايج، نشان دهنده‌ي تكثير قطعه‌ي مورد نظر از ژن به طول 294 نوكلئوتيد بود كه LsFT ناميده و در پايگاه ژن NCBI با شماره‌ي دسترسي KP070729 ثبت شد. اين قطعه از ژن، كدكننده‌ي بخش عمده‌ي قلمرو پروتئين متصل شونده به فسفاتيديل اتانول آمين (PEBP) است كه توالي آمينواسيدي آن در گياهان، به‌ميزان بسيار زيادي حفاظت شده است. مقايسه‌ي توالي پروتئين استنباطي LsFT با ساير هم‌ساخت‌هاي FT نشان دهندهي شباهت بين 61 تا 94 درصدي اين توالي با توالي‌هاي مشابه بود. مطابق اين نتايج، LsFT نيز به ‌عنوان هومولوگ FT در تحريك گل‌دهي نقش دارد و مي‌تواند به‌عنوان ژن محرك گل‌دهي در شاهي عمل كند.

The transition to flowering is a major phase change in life cycle of plants. Flowering locus T (FT) gene is the final signaling target gene of the photoperiod pathway that promotes flowering. FT protein is a major component of flowering hormone (florigen). This study was performed to identify FT homologus gene in garden cress (Lepidium sativum L.). Total RNA was isolated from young leaf tissues of L. sativum in reproductive phase and was used for first-strand cDNA synthesis. The specific primers were designed based on nucleotide sequence alignment of FT homologus genes from other plants and were used in RT-PCR. The RT-PCR product were purified and sequenced. The results indicated amplification of 294 nucleotides fragment that was named LsFT and registered in NCBI database with access number KP070729. This part of FT gene codes major part of phosphatidyl ethanolamine-binding Protein (PEBP) domain of FT protein that is conserved in amino acid sequence in many plants. Comparison of this deduced protein with FT homologous proteins from other species showed %61 to %94 identity. According to these results, LsFT can play a similar role as FT in flowering induction and could act as a flowering inducer gene in Lepidium sativum L.