شناسايي ميكرو RNAهاي جديد در كلزا (.Brassica napus L) و نقشي كه در سركوب ژن‌هاي هدف به‏عهده دارند

ميكرو RNAها گروهي از RNAهاي كوچك غيررمزكننده پروتئين مي باشد كه داراي تقريبا 18 تا 24 طول دارند. اين RNAهاي كوچك در تغييرات پس از رونويسي در يوكاريوت‏ها نقش سركوب كننده mRNA هدف را به عهده دارند. ميكرو RNAها به‎طور مستقيم بر فرآيندهاي مانند رشد و نمو، ريخت شناسي، زمان گلدهي، سوخت و ساز، متابوليسم اسيدهاي چرب، گليكوليز و پاسخ به تنش‌هاي زنده و غير زنده در گياهان تاثيرگذار هستند. شناسايي ميكرو RNAها به روش‌ داده‌هاي زيستي انجام گرفت. توالي‌هاي miRAN بالغ شناخته‎شده از شمار زيادي گونه جانوري و گياهي از پايگاه داده miRBase دانلود گرديد. از توالي‎هاي miRNA به‌عنوان توالي شناخته‎شده براي يافتن miRNAهاي حفاظت‎شده بر پايه جستجوي همساني بين miRNAها با GSSهاي گياه كلزا استفاده شد. ابتدا توالي‎هاي GSS در گياه كلزا از بانك اطلاعاتي NCBI در برابر miRNAهاي شناخته‌شده BLASTn شدند. براي شناسايي رونوشت‎ها و ژن‏هاي هدف از تشابه مكمل معكوس بين miRNA و رونوشت هدف استفاده شد. در نهايت پنج عدد miRNA بالغ جديد شناسايي‌گرديد. ژن‌هاي مانند LUC7L3 ,UEL1D ,WSD1 ,LBD41 ,HST,NST1 ,CIPK26 و CNOT11 كه به چندين خانواده ‎ژني با عملكردهاي بيولوژيكي مختلف تعلق داشتند، شناسايي‎شد. در اين تحقيق از سرورها و نرم‏افزارهاي مانند Mfold، miRBase، psRNATarget و GC content استفاده شد.