شناسايي بيوانفورماتيكي ‫ microRNA هاي با توان بيوماركري در سرطان روده بزرگ از روي داده‌هاي ريز آرايه

زمينه و هدف: سرطان روده بزرگ يك بيماري شايع در جهان مي‫باشد كه باعث مرگ و مير بالايي در افراد مبتلا مي‫شود. نبود ماركر مناسب تشخيصي و پيش آگهي باعث عدم شناسايي بدخيمي‫هاي سرطان كولون در زمان مناسب شده است. ژن‫هاي microRNA با كنترل بيان ژن‫هاي هدف در بروز و پيشروي سرطان كولون نقش مهمي را ايفا مي‫كنند. هدف از مطالعه حاضر، شناسايي بيوانفورماتيكي microRNA هاي احتمالي موثر با بيان متمايز در نمونه هاي سرطاني و غيرسرطاني كولون بود. روش كار: اين مطالعه از نوع تئوريكال بيوانفورماتيكي بوده و داده هاي ريزآرايه مربوط به 1513 نمونه سرطان روده با شماره دستيابي GSE115513 از سايت GEO انتخاب شد و با استفاده از برنامه R، ژن‫هاي ماركر انتخاب گرديد. ژن‫هاي هدف microRNA هاي شناسائي شده با برنامه TARGETSCAN مشخص شدند و در نهايت، شبكه گرافيكي با برنامه Cytoscape رسم گرديد. يافته ها: آناليز داده هاي ريزآرايه نشان داد كه has miR663b، hasmiR650، has miR175p، hasmiR4539 و hasmiR5013p داراي توان بيوماركري در نمونه هاي سرطاني مي‫باشند. آناليز آماري و بررسي ژن‫هاي هدف اين microRNA نشان داد كه ژن‫هاي hasmiR663b (p=0.001 و ROCAUC=0.8965) و hasmiR650 (p=0.001 و ROCAUC=0.9104) داراي بيان متمايز معني دار بين نمونه هاي سرطاني و حاشيه غيرتوموري بوده و توان بيوماركري دارند. نتيجه گيري: ژن‫هاي has miR663b و hasmiR650 مي‫توانند به عنوان ماركر تشخيصي براي تفكيك نمونه هاي سرطاني روده بزرگ از نمونه هاي غيرسرطاني بكار گرفته شوند.