بررسي تنوع ژنتيكي ژنوتيپ هاي عناب (Ziziphus jujuba Mill.) كلكسيون مركز تحقيقات و آموزش كشاورزي و منابع طبيعي استان خراسان جنوبي با استفاده از نشانگرهاي SSR و RAPD

Evaluation of genetic diversity in south Khorasan province Agricultural and Natural Resources Research and Education Center Collection jujube genotypes (Ziziphus jujuba Mill.) using SSR and RAPD markers

عناب (Ziziphus jujuba Mill.) با كشت طولاني مدت در ايران، داراي ارزش و اهميت دارويي و اقتصادي مي باشد. اطلاع از تنوع ژنتيكي جهت مديريت موثر و كارآمد منابع ژنتيكي، شناسايي گونه ها و روابط ژنتيكي بين آنها مفيد خواهد بود. براي ارزيابي تنوع ژنتيكي 25 درخت عناب كلكسيون مركز تحقيقات و آموزش كشاورزي و منابع طبيعي استان خراسان جنوبي، از 16 آغازگر RAPD و 22 جفت آغازگر SSR استفاده شد. هر دو نشانگر چندشكلي بالايي نشان دادند. قدرت تمايز نشانگرها با درصد چندشكلي، شاخص محتواي اطلاعات چندشكلي (PIC)، قدرت تفكيك (RP)، شاخص نشانگر (MI) و شاخص موثر چندگانه (EMR) مقايسه شد. آغازگرهاي RAPD، 108 و در مقابل آغازگرهاي SSR، 118 باند چندشكل تكثير كردند. مقدار متوسط PIC ، EMR و MIدر نشانگر SSR (به ترتيب 0.47, 5.36, 2.58,) نسبت به نشانگر RAPD (به ترتيب 0.19, 3.55, 0.76,) بيشتر بود. به هرحال نشانگر RAPD مقدار RP بيشتري (9/29) نسبت به SSR (2/10) نشان داد. گروه بندي نمونه ها براساس دندروگرام ترسيم شده به روش UPGMA نشان داد كه پاجوش هاي حاصل از يك ژنوتيپ از هم تفكيك شدند كه نشان از وقوع جهش سوماتيكي در بين آنها بود. دندروگرام حاصل از تركيب داده هاي SSR و RAPD، اكثر پاجوش ها از ژنوتيپ هاي يكسان را در خوشه هاي يكساني قرار داد.

Jujube (Ziziphus jujuba Mill.) is cultivated for a long time in Iran, which has medicinal and economic value. In order to effective management of genetic sources, identifying species and determination on the genetic relationships between them, knowledge of genetic diversity will be helpful. To evaluate genetic diversity of 25 trees collected from South Khorasan Agricultural and Natural Resources Research and Education Center Collection, 16 RAPD and 22 SSR primers were used. Both the markers showed highly polymorphic. Distinctive power of two markers were compared using percent of polymorphism, polymorphic information content (PIC), resolving power (RP), marker index (MI) and effective multiplex ratio (EMR). RAPDs produced 108 polymorphic bands, while SSRs amplified 118 polymorphic bands. SSRs showed higher PIC, EMR and MI (0.47, 5.36, 2.58, respectively) than RAPDs (0.19, 3.55, 0.76, respectively). However, RP of RAPDs (9.92) higher than to SSRs (2.10). The dendrogram drawn with UPGMA cluster analysis showed that root-suckers of the same rootstock were separated from each other, which is indicative of the occurrence of somatic mutation among them. Dendrogram derived from the combination of SSR and RAPD datas, divided most of root-suckers from the same rootstock into same clusters.