بررسي تغييرات بيان LncRNA RMRP و موتاسيون هاي ناحيه پروموتري ژن RMRP در بيماران مبتلا به سرطان سينه

Study of LncRNA RMRP expression profile and RMRP gene promoter region mutations in breast cancer patients

تنظيم كننده هاي بيان ژن و جهش توموري ، ازماركرهاي پيش آگهي دهنده وتشخيصي براي سرطان مي باشند. RNAهاي بلند غيركد كننده (lncRNAs) ، درفرآيندهاي تنظيمي متعدد نقش دارند. RMRP يك lncRNA مي باشد كه نقش تنظيمي آن دربرخي ازسرطان هامشخص شده است. با توجه به اهميت RMRP، به بررسي تغييرات بيان آن كه به دنبال موتاسيون هاي ناحيه پروموتردربيماران مبتلا به سرطان سينه ايجاد مي شود، پرداخته شد. روش بررسي دراين پژوهش بيان LncRNA RMRP با استفاده از تكنيك نيمه كمي RT-PCR ، برروي 25 نمونه توموري و 25 نمونه كنترل حاشيه تومور ارزيابي شد و توسط تكنيك Real time PCR براي تعدادي از نمونه ها تاييد گرديد. همچنين براي بررسي وجود جهش در ناحيه پروموتري ژن LncRNA RMRP ، استخراج DNA و تعيين سكانس صورت گرفت. يافته ها بيان RMRP درنمونه هاي توموري نسبت به نمونه هاي كنترل، افزايش بيان معناداري نشان داد. RMRP درنمونه هاي HER2 مثبت نسبت به نمونه هاي HER2 منفي كاهش بيان و در نمونه هاي توموري متاستاز مثبت نسبت به نمونه هاي متاستاز منفي افزايش بيان معناداري را نشان داد. توالي پروموتري ژن RMRP نمونه توموري هيچ جهشي وجود نداشت و تفاوتي با سكانس wild type مشاهده نشد. نتيجه گيري نتايج بدست آمده در اين پژوهش، حاكي از آن است كه RMRP مي تواند به عنوان تومور ماركر و متاستاز ماركري براي شناسايي گروه هاي مختلف سرطان سينه پيشنهاد گردد. اما همچنان به بررسي هاي باليني و مولكولي بيشتري براي اثبات دقيق تر آن نياز مي باشد.

Gene expression regulators and mutations are a kind of biomarker and new therapeutic target for human diseases like cancer. LncRNAs are involved in Several regulatory processes. RNA components of mitochondrial RNA processing endoribonuclease is a lncRNA that its regulatory position has been identified in some cancers. Regarding the importance of the RMRP gene, we are investigating changes in the expression of this gene that are caused by promoter region mutations in breast cancer patients. Methods In this study, LncRNA RMRP gene expression was evaluated on 25 tumor samples and 25 control samples by semi-quantitative RT PCR technique, and confirmed by Real time PCR technique for a number of samples. Also, to detect the mutation in the promoter region of the LncRNA RMRP gene, DNA extraction and sequencing were performed. Results The expression of the RMRP gene in tumor samples showed a significant increase relative to control samples. Expression of RMRP gene was shown a significant decrease in positive HER2 samples compared to negative HER2 specimens and a significant increase in positive metastatic tumor samples compared to negative metastatic samples . Also, sequencing of the promoter region revealed differences in the region's sequence in tumor and normal samples.Based on sequencing results, there was no mutation in the RMRP promoter sequence of the tumor . Conclusion The RMRP gene can be suggested as a tumor and metastatic marker for the detection of breast cancer. But more clinical and molecular research is still needed to prove it more accurately.