شناسايي ژن‌هاي فيمبريايي و ژن‌هاي مقاومت به فلوروكينولون‌ها و بتالاكتامازهاي وسيع الطيف (ESBL) در اشريشيا كلي‌هاي جدا شده از مدفوع گاوميش در استان آذربايجان‌غربي

Identification of Fimbrial genes and floroquinolons and extended spectrum beta lactamase resistant gene in Escherichia coli isolated from buffalo in west Azerbaijan

مطالعه حاضر با هدف شناسايي ژن­ هاي فيمبريايي، ژن­ هاي مقاومت به فلوروكينولون­ ها و بتالاكتامازهاي وسيع ­الطيف انجام شد. از تعداد 384 گاوميش از مناطق مختلف استان آذربايجان­ غربي و در فصول مختلف به‌صورت تصادفي نمونه­ هاي مدفوع جمع ­آوري گرديد. شناسايي باكتري اشريشيا كلي در نمونه هاي مدفوع با استفاده از روش­هاي كشت و بيوشيميايي انجام گرفت. روش واكنش زنجيره­ اي پلي­مراز (PCR) و با استفاده از جفت پرايمرهاي اختصاصي، حضور ژن­هاي فيمبريايي (fimA، crl، csgA)، ژن tsh، ژن­هاي مقاومت به فلوركينولون­ها (qnrA، qnrB، qnrS) و ژن­هاي مقاومت به بتالاكتامازهاي وسيع‌الطيف (blaSHV،blaTEM ، blaCTX-M-9) مشخص گرديد. از 384 نمونه مدفوع جمع­آوري­شده از تعداد 115 (9/29 %) نمونه­ باكتري اشريشيا كلي شناسايي و جداسازي گرديد. آلودگي به اشريشيا كلي در شمال استان به ­طور معني­داري كمتر از جنوب و مركز استان بود و اختلاف معني­داري از نظر الودگي گاوميش ­ها به اشريشيا كلي در فصول مختلف وجود نداشت (05/0P<). فراواني ژن­هاي فيمبريايي fimA، crl و csgA به ­ترتيب 1/79%، 1/72%، 7/74% بود و ژن tsh داراي كمترين فراواني (2/18%) در جدايه­ هاي اشريشيا كلي بودند. در بين ژن­هاي مقاومت به فلوركينولون­ ها و بتالاكتامازهاي وسيع الطيف ژن qnrS داراي كمترين فراواني (0/6%) و ژن blaTEM داراي بيشترين فراواني (9/13%) بود. نتايج به‌ دست­ آمده در اين مطالعه حضور باكتري اشريشيا كلي را در نمونه ­هاي مدفوع كمتر از يك سوم گاوميش‌هاي نمونه­ برداري شده نشان داد. ژن­هاي فيمبريايي تقريباً داراي فراواني مشابهي بودند و ژن­هاي مقامت آنتي‌بيوتيكي در كمتر از 14% جدايه­ هاي اشريشيا كلي در گاو ميش حضور داشتند. ارزيابي حضور ژن‌هاي مقاومت آنتي ­بيوتيكي در جدايه­ هاي باكتريايي با منشأ حيواني مي­تواند از نظر اپيدميولوژيك و بهداشت عمومي اهميت زيادي داشته باشد.

The present study aimed to identify fimbria, fluroquinolone and extended-spectrum betalactamase (ESBLs) resistant genes in Escherichia coli isolated from buffalo feces. In this study, a number of 384 buffalo feces from different regions of west Azerbaijan and in different seasons were randomly collected. Fecal samples were cultured and E. coli were investigated using biochemical method. Polymerase chain reaction was employed to identify fimbria genes (fimA, crl and csgA), tsh gene, floroqinulone (qnrA, qnrB, qnrS) and extendedspectrum beta-lactamase (blaSHV, blaTEM, blaCTX-M) resistance genes. A number of 115 (29.9%) fecal samples were positive for E. coli. The frequency of the positive fecal for E. coli from northern region were significantly lower than central and southern regions (P<0.05). The frequency of positive fecal samples for E. coli did not differ between seasons. The frequency of fimbria genes fimA, crl and csgA were 79.1%, 72.1% and 74.7% respectively. tsh gene had the lowest frequency in E. coil isolates. Among fluroquinolone and extended-spectrum betalactamase resistance genes, qnrS gene had the lowest (6.0%) and blaTEM had the highest (13.9%) frequencies. The results revealed that E. coli was isolated from less than one third of fecal samples. Fimbria genes had almost similar frequencies among E. coli isolates and antibiotic resistance genes were exist in less than 14% of E. coli isolates from buffalo feces. The investigation of antibiotic resistance genes in E. coli originated from animals is of great epidemiological and public health importance.