افزايش بيان ژن‌هاي TPT1-AS1 و SAMMSON و كاهش بيان ژن LNC00961 به عنوان نشانگر‌هاي بالقوه تومور در سرطان معده

Up-Regulation of TPT1-AS1 and SAMMSON and Down-Regulation of LINC00961 Long Non-Coding RNAs (lncRNAs) as Potential Tumor Markers in Gastric Cancer

سابقه و هدف: سرطان معده يكي از كشنده‌ترين سرطان‌ها در جهان است. اخيراً LINC00961، TPT1-AS1 و SAMMSON كشف شده‌اند كه به‌طور قابل توجهي در سرطان‌هاي مختلف نقش دارند. هدف از اين مطالعه تعيين ميزان بيان اين ژن‌ها در بافت‌ سرطاني در مقايسه با بافت‌ مجاور سالم و ارتباط بيان آن‌ها با ويژگي‌هاي باليني است. مواد و روش‌‌ها: در اين مطالعه مورد-شاهدي، بيان LINC00961، SAMMSON و TPT1-AS1 در 40 جفت نمونه بافت سرطاني و بافت مجاور سالم با استفاده از qRT-PCR بررسي شد. تجزيه‌وتحليل آماري و نمودار ارتباط بين سطح RNA و خصوصيات كلينيكوپاتولوژيك با استفاده از نرم‌افزار SPSS نسخه 16 و Prism 5.00 انجام شد. منحني ROC براي نشان‌دادن حساسيت و ويژگي LINC00961، SAMMSON و TPT1-AS1 به‌عنوان نشانگرهاي زيستي سرطان معده ترسيم شدند. يافته‌ها: بيان ژن‌هاي TPT1-AS1 و SAMMSON افزايش و بيان ژن LINC00961 كاهش يافته بود. نتايج نشان داد سطح TPT1-AS1 و SAMMSON در سرطان معده با اندازه و درجه تومور همبستگي دارد. تجزيه‌وتحليل منحني ROC از سطح LINC00961 و SAMMSON نشان داد اين دو lncRNA مي‌توانند بافت سرطاني و بافت مجاور سالم را از يكديگر تميز دهند. نتيجه‌گيري: بر اساس نتايج به‌دست‌آمده، LINC00961، SAMMSON و TPT1-AS1 ممكن است با توجه به مسير‌هاي پيام‌رسان سلولي خود نقش مهمي در تشديد و حتي شروع سرطان معده داشته باشند.

Background and Objective:Gastric Cancer (GC) is one of the deadliest cancers in the world. Recently, LINC00961, TPT1-AS1, and SAMMSON Long non-coding RNA (lncRNAs)have been discovered, which significantly contribute to the occurrence of various cancers. This study aimed to determine the expression levels of these genes in GC tissues, compared to healthy adjacent tissues, and the relationship of their expressions with clinical characteristics. Materials and Methods:In this case-control study, the expression of LINC00961, SAMMSON, and TPT1-AS1 were evaluated in 40 pairs of cancerous and adjacent non-cancerous tissue samples in GC patients using qRT-PCR. Statistical analysis and graphing of the relationship between RNA levels and the clinic-pathological characteristics of GC were carried out using SPSS and Prism 5.00 software. Furthermore, Receiver Operating Characteristic (ROC) curve was drawn to represent the sensitivity and specificity of LINC00961, SAMMSON, and TPT1-AS1 expression as biomarkers of GC. Results:The expression of TPT1-AS1 and SAMMSON were significantly up-regulated, and the expression of LINC00961 was significantly decreased in GC specimens, compared to adjacent control samples. Our results showed that TPT1-AS1 and SAMMSON RNA levels in GC were significantly related to the tumor size and histopathological grade. Moreover, the ROC curve analysis of LINC00961 and SAMMSON RNA level demonstrated that these two lncRNAs had an appropriate sensitivity and specificity for the diagnosis goals. Conclusion:Based on the results, LINC00961, SAMMSON, and TPT1-AS1 may play critical roles in exacerbating and even initiating GC due to their cellular pathways.