عنوان مقاله :
بررسي تنوع ژنتيكي جدايه هاي استافيلوكوكوس اورئوس مقاوم به متي سيلين جداسازي شده از نمونه هاي باليني با روش RAPD-PCR
عنوان به زبان ديگر :
Study of genetic variation in Staphylococcus aureus strains isolated from clinical specimens by RAPD-PCR Technique
پديد آورندگان :
مرواريدي، برومند دانشگاه آزاد اسلامي واحد بروجرد- گروه زيست شناسي , نخجوان، شهرام دانشگاه آزاد اسلامي واحد بروجرد - گروه اصلاح نباتات , ننه كراني، شهرام دانشگاه آزاد اسلامي واحد بروجرد - گروه علوم دامي , ياري، رضا دانشگاه آزاد اسلامي واحد بروجرد - گروه بيولوژي
كليدواژه :
استافيلوكوكوس اورئوس , متي سيلين , تنوع ژنتيكي , RAPD-PCR , قم
چكيده فارسي :
سابقه و هدف
استافيلوكوك اوريوس مقاوم به متي سيلين عامل مهم عفونت هاي اكتسابي بيمارستاني است. تنوع ژنتيكي در استافيلوكوكوس اوريوس مي تواند بر پاسخ به درمان تاثير بگذارد و لذا شناسايي آنها در انتخاب آنتي بيوتيك هاي كارآمد، موثر مي باشد. در اين مطالعه سعي شد تا تنوع ژنتيكي جدايه هاي MRSA با پرايمرهاي تصادفي تعيين گردد.
مواد و روش كارها
پژوهش توصيفي- مقطعي حاضر در سال 1394 بر روي 50 ايزوله MRSAانجام شد. ژنوم با روش Boiling استخراج گرديد. تكنيك RAPD-PCR با 16پرايمر انجام و قرابت ژنتيكي ايزوله ها با استفاده از ماتريس يك و صفر و خوشه بندي و رسته بندي با كمك نرم افزار NTSYS و MVSP انجام شد.
نتايج
ﺑﯿﺸﺘﺮﯾﻦ و ﮐﻤﺘﺮﯾﻦ ﺑﺎﻧﺪﻫﺎي ﺗﻮﻟﯿﺪي ﻣﺮﺑﻮط ﺑﻪ ﭘﺮاﯾﻤﺮﻫﺎي M4 و M9 ﻣﯽ ﺑﺎﺷﺪ. ﺑﯿﺸﺘﺮﯾﻦ ﻣﯿﺎﻧﮕﯿﻦ ﺑﺎﻧﺪ ﺑﺮاي ﻫﺮ اﯾﺰوﻟﻪ- ﭘﺮاﯾﻤﺮ ﻣﺮﺑﻮط ﺑﻪ ﭘﺮاﯾﻤﺮ M4 ﺑﺎ 8/1 ﺑﺎﻧﺪ اﺳﺖ. ﺑﯿﺸﺘﺮﯾﻦ ﺑﺎﻧﺪ ﭘﻠﯿﻤﺮف ﺑﺎ 36 ﺑﺎﻧﺪ ﻣﺮﺑﻮط ﺑﻪ ﭘﺮاﯾﻤﺮ M5 ﻣﯽ ﺑﺎﺷﺪ. ﺑﺰرگ ﺗﺮﯾﻦ و ﮐﻮﭼﮏ ﺗﺮﯾﻦ ﺑﺎﻧﺪﻫﺎ ﻣﺮﺑﻮط ﺑﻪ ﭘﺮاﯾﻤﺮ M2 ﺑﺎKb 3/6 و ﭘﺮاﯾﻤﺮ M12 ﺑﻪ ﻣﯿﺰان 100bp ﺑﻮد. 16 آﻏﺎزﮔﺮ 583 ﺑﺎﻧﺪ ﺗﺸﮑﯿﻞ دادﻧﺪ ﮐﻪ 412 )70/91%( ﺑﺎﻧﺪ ﭘﻠﯿﻤﺮف و 171 )29/09%( باند اختصاصي بود.اين روش ايزوله ها را به دو خوشه عمده تقسيم بندي كرد.
نتيجه گيري
مطالعه نشان داد ايزوله ها از نظر ژنتيكي هتروژن مي باشند. نتايج بيانگر توانايي RAPD-PCR در تمايز ايزوله ها است. رعايت بهداشت توسط افراد مراجعه كننده به مراكز درماني و نيز استريل لوازم و وسايل مورد استفاده عمومي بيماران و مراجعان اين مراكز مورد تاكيد است.
چكيده لاتين :
Methicillin Resistant-Staphylococcus aureus (MRSA) has been introduced
as important factor in Hospital-Acquired Infections (HAI). Diversity in Staphylococcus
strains can affect the response to treatment and identifying of strains can be effective in the
selection of antibiotics. The aim of this study was to determine the genetic diversity of
MRSA isolates with random primers.
Material and Methods: This cross-sectional descriptive study was performed in 2015 on
50 MRSA isolates of clinical skin samples. Genomes were extracted by Boiling method.
RAPD-PCR method was performed by 16 random primers. To investigate the genetic
similarity, matrix 1/0, NTSYS and MVSP software's were used. One-dimensional clustering
and ordinations were conducted.
Results: The highest and lowest produced bonds related to M4 and M9 primers
respectively. The greatest mean produced bands for each isolate/primer up to 8.1 relates to
M4 primer. The most polymorphic bands, 36 bands belonged to M5 primer. The heaviest
band, 3.6 Kb produced by M2 primer and the lightest band, 100 bp produced by M12 primer.
A total of 16 primers, 583 bands formed that were 412 (70.91%) polymorphic bands and 171
(29.09%) specific bands. RAPD-PCR divided isolates into two clusters.
Conclusion: This study showed that these isolates are very heterogeneous genetically.
RAPD-PCR is important in rapid detection of an epidemic outbreak, tracing the origin of the
infection and the subsequent managing of infection control. Therefore, the present study tries
to develop this approach and apply it in health management by providing information about
the genetic diversity of MRSA.
عنوان نشريه :
بيولوژي كاربردي
