عنوان به زبان ديگر :
Evaluation of the Frequency of the Uropathogenic Escherichia coli Genotypes Resistant to Multidrug using the iucA, iucB, iucC, and iucD Siderophore Genes
پديد آورندگان :
آب روشن، ريحانه دانشگاه آزاد اسلامي واحد ارسنجان - دانشكدۀ علوم پايه - گروه زيست‌شناسي، ارسنجان، ايران , شاه ايلي، مرجان دانشگاه آزاد اسلامي واحد ارسنجان - دانشكدۀ علوم پايه - گروه زيست‌شناسي، ارسنجان، ايران
كليدواژه :
اشريشياكلي يوروپاتوژن , سيدروفور , ژنهاي MDR , icu
چكيده فارسي :
عفونت مجاري ادراري يكي از رايجترين عفونتهاي باكتريايي در انسان است و مهم‌ترين عامل آن باكتري اشريشياكلي است؛ ازاين‌رو، پژوهش حاضر به‌منظور ارزيابي تنوع ژنوتيپهاي اشريشياكلي يوروپاتوژنيك بر اساس ژنهاي iucA، iucB، iucC و iucD انجام‌شده است.
مواد و روش ها: در اين پژوهش، از 4 مركز درماني شهر شيراز، 130 نمونه از پليت‌هاي حاوي كشت مثبت عفونتهاي ادراري اشريشياكلي جمع‌آوري گرديد و پس از تعيين هويت فنوتيپي و ژنوتيپي، 100 ايزولۀ اشريشياكلي يوروپاتوژن جدا شد. استخراج ژنوم باكتري‌ها با استفاده از كيت صورت گرفت و پس از تأييد ژنتيكي جدايه ها با استفاده از rRNA S16، مقاومت و حساسيت آنتيبيوتيكي براي 10 آنتيبيوتيك از 9 كلاس با روش ديسك ديفيوژن بر اساس استاندارد CLSI انجام شد. بررسي فراواني فاكتورهاي ويرولانس (ژن iuc) با استفاده از روش مولكولي PCR و پرايمر‍‌هاي اختصاصي صورت گرفت.
يافتههاي پژوهش: ميزان شيوع براي ژنهاي iucA 95 درصد، iucB60 درصد، iucC 72 درصد و iucD 92 درصد به‌دست آمد. ميزان مقاومت به 10 آنتيبيوتيك آزيترومايسين، آمپيسيلين، سفوتاكسيم، ناليديكسيك اسيد، تتراسيكلين، تريمتوپريم-سولفامتوكسازول، سفپيم، آزترونام، جنتامايسين و نيتروفورانتوئين به ترتيب 95 درصد، 86 درصد، 68 درصد، 66 درصد، 65 درصد، 64 درصد، 51 درصد، 46 درصد، 44 درصد و 14 درصد ارزيابي شد؛ همچنين 98 درصد نمونه‌ها مقاومت چنددارويي داشتند.
بحث و نتيجه گيري: پژوهش حاضر نشان داد كه شيوع بالاي ژنهاي iuc در ميان سويه‌هاي اشريشياكلي، بيانگر اهميت اين ژن در ايجاد بيماري و تنوع ژنتيكي باكتري است
چكيده لاتين :
Introduction: Urinary tract infection is one of the most common bacterial infections in humans, and Escherichia coli is one of the most important factors. Therefore, the present study aimed to evaluate the diversity of Europathogenic E. coli genotypes based on iucA, iucB, iucC, and iucD genes.
Materials & Methods: In this study, plates containing a positive culture of urinary tract infection of E. coli were collected from four treatment centers in Shiraz, Iran. After determining phenotypic and genotypic identity, 100 isolates of E. coli were isolated. The bacterial genome was extracted using a kit. After genetic confirmation of the isolates using 16S rRNA, antibiotic resistance and susceptibility were performed for 10 antibiotics out of 9 classes using the disk diffusion method according to the CLSI standard. Frequency investigation of the virulence factors (iuc gene) was performed through the PCR molecular method and specific primers.
Findings: The prevalence rates of iucA, iucB, iucC, and iucD genes were estimated at 95%, 60%, 72%, and 92%, respectively. The amount of resistance of 10 antibiotics of azithromycin, ampicillin, cefotaxime, nalidixic acid, tetracycline, trimethoprim-sulfamethoxazole, cefepime, aztreonam, gentamicin, and nitrofurantoin were also determined at 95%, 86%, 68%, 66%, 65%, 64%, 51%, 46%, 44%, and 14%. In addition, 98% of the isolates had multidrug resistance.
Discussions & Conclusions: The present study showed that the high prevalence of the iuc gene among E. coli strains indicated the importance of this gene in the pathogenesis and genetic diversity of this bacterium.
