بررسي فيلوژني مولكولي ماهي شانك كوپر(Argyrops spinifer) در محدوده خليج فارس و درياي عمان(بندر بوشهر ،بندرعباس، بندرچابهار)

Molecular Phylogeny of King soldier bream (Argyrops spinifer) in the Persian Gulf and Oman Sea (Bandar Boushehr, Bandar Abbas , Bandar Chabahar)

زمينه و هدف: ماهي كوپر(Argyrops spinifer) از خانواده شانك ماهيان(Sparidae) بوده كه از نظر تجاري و اكولوژيكي در آب­هاي جنوب ايران بسيار حائز اهميت است. گونه هاي اين شاخه از نظر ريخت شناختي بسيار به هم نزديك مي باشند و گاهي نام­گذاري آن ها دچار خطا مي شود. بنابراين، شناسايي مولكولي آن ها بسيار مهم مي باشد. روش كار: در اين مطالعه بررسي رابطه فيلوژني ماهي كوپر بر اساس ناحيه ميتوكندريايي(CO1) و با استفاده از روش توالي يابي DNA انجام گرفت. به منظور اين بررسي از بافت نرم باله دمي90 نمونه با استفاده از روش استات آمونيوم، DNA استخراج و كميت و كيفيت آن به روش هاي اسپكتروفتومتري و الكتروفورز انجام شد. نمونه هايDNA مطلوب براي واكنش زنجيرهاي پليمراز(PCR) و توالي يابي(Sequencing) مورد بررسي قرار گرفت. پس از تكثير قطعه ژن و توالي يابي ، براي ترسيم درخت هاي تبارشناسي از نرم افزارهايBio Edite version 7.0.1 ، BLAST، MEGA 7.0.2 و DnaSP 5.10.01 استفاده گرديد. يافته ها: بر اساس درخت فيلوژني به دست آمده از توالي ها، ماهي شانك(كوپر) در مناطق بندر عباس، بوشهر و بندر چابهار، به دو شاخه اصلي تقسيم شد. تمامي نمونه هاي شاخه اول با شاخه دوم رابطه خواهري نشان دادند و تمام نمونه هاي شاخه يك و دو با نمونه‌هاي KJ012292 وKJ012291 از بانك ژن در منطقه ايتاليا با دقت 82، 67 و 86 درصد رابطه خواهري نشان دادند. نتيجه گيري: نتايج حاصل مي تواند اطلاعات سودمندي در برنامه هاي حفاظتي و مديريتي جهت حفظ و احياي جمعيت و ذخايراين گونه با ارزش فراهم سازد.

Inroduction & Objective: King soldier bream is one of the species of family Sparidae, which is commercially and ecologically very important in the Iranian waters of the Persian Gulf and Oman Sea. The species of this family are morphologically very similar to each other and they may be mistakenly known as another species. Therefore, molecular identification of them has to be considered. Materials and Methods: In this study, the phylogenetic relationship of king soldier bream fish based on mitochondrial region(CO1) was investigated using DNA sequencing method. For this purpose, 90 samples were collected from the soft tissue of the caudal fin using Ammonium acetate, and its quantity and quality were determined by Spectrophotometry and Electrophoresis. Optimal DNA samples for Polymerase Chain Reaction (PCR) and sequencing were examined. After gene amplification and sequencing, Bio Edit version 7.0.1, BLAST, MEGA 7.0.2 and DnaSP 5.10.01 software were used to draw phylogenetic trees. Results: Based on the phylogenetic tree obtained from the sequences, king soldier bream was divided into two main branches in Bandar Abbas, Bandar Bushehr and Bandar Chabahar areas. All samples of the first branch showed a sister relationship with the second branch and all the samples of branches one and two showed sisterhood with samples KJ012292 and kJ012291 from the Gene Bank in Italy with 82, 67 and 86% accuracy. Conclusion: The results can provide useful information on the conservation and management programs, for the preservation, revitalization, and resource of the population this valuable species.