بررسي جهش ها در ژن NF1 در بيماران ايراني مبتلا به نوروفيبروماتوز نوع 1

mutation analysis of the NF1 gene in Iranian patients with neurofibromatosis type 1

نوروفيبروماتوز نوعي بيماري پوستي-عصبي است و با بروز تومورهايي در اطراف اعصاب مشخص مي‌گردد. ژن NF1 حدود 350 كيلو جفت باز طول داشته و شامل 60 اگزون است و پروتئيني به نام نوروفيبرومين را كد مي كند. به دليل اندازه بزرگ ژن NF1 و نيز تنوع انواع جهش‌ها، شناسايي جهش‌هاي اين ژن چالشي بزرگ است بنابراين در اين تحقيق به بررسي جهش هاي ‌ ژن NF1 در 10 بيماران ايراني مبتلا به نوروفيبروماتوز نوع1 پرداخته شد. پس از خونگيري و استخراجDNA ژنومي 15 اگزون از ژن NF1 با استفاده از تكنيك PCR تكثير و توالي يابي انجام شد. در نهايت قطعات توالي يابي شده با توالي اگزون هاي مرجع با استفاده از نرم افزارهاي بيوانفورماتيكي مقايسه گرديد و جهش هاي موجود شناسايي شد. نتايج نشان داد كه در اگزون 40 جهش c.5811-5811 delT، در اگزون 35 جهش c.4537 C>T، و در اگزون هاي 41-42 جهش c.6259-6260 insA وجود دارد. نتايح اين مطالعه ضمن گزارش جهش هاي رخداده در بيماران ايراني مي تواند در مشاوره ژنتيكي و بررسي هاي بيشتر اين بيماري در ايران كمك كننده باشد.

Neurofibromatosis is a skin-neurological disease characterized by tumours around the nerves. The NF1 gene has 350kb long and contains 60 exons and encodes a protein called neurofibromin. Due to the large size of the NF1 gene and the diversity of mutations, identifying mutations in this gene is a major challenge. In this study, 10 patients with Type 1 neurofibromatosis were taken and genomic DNA was purified using salting out method. Following the design of the primers, sequencing was performed after amplification of the 15 exon fragments using PCR. Finally, sequenced fragments were compared with reference exons using the Pairwise Sequence Alignment software, and mutations were identified by considering the polymorphism and variants. The results showed that small-scale mutations such as deletion, insertion, replacement in exons of NF1 gene were present, as well as exons 40 (c.5811-5811 delT), exon 35 (c.4537 C>T) and exone 41-42 ( c.6259-6260 insA .( In conclusion, these results help to better understand the molecular mechanisms of the disease, as well as genetics counseling of NF1.