شناسايي مولكولي باكتري استنوتروفوموناس مالتوفيليا جدا شده از نمونه هاي باليني و محيطي بيمارستان هاي كرمانشاه

Molecular identification of Stenotrophomonas maltophilia isolated form patients and environments in Kermanshah hospitals

هدف: شناسايي مولكولي باكتري استنوتروفوموناس مالتوفيليا جدا شده از نمونه هاي باليني و محيطي بيمارستان هاي كرمانشاه روش كار: 500 نمونه باليني و محيطي مختلف جمع آوري و توسط تست هاي بيوشيميايي و PCR شناسايي شد. در مرحله بعد سويه هاي باكتري با تكثير 7 لوكوس ژني شامل atpD، gapA، guaA، mutM، nuoD، ppsA و recA مشخص و تعين توالي شد. رسم درخت فيلوژني مربوط به سويه ها با نرم افزارMEGAv.7 صورت گرفت. نتايج: از ميان500 نمونه جمعآوري شده از بيمارستان ها، تعداد 28 ايزوله استنوتروفوموناس مالتوفيليا شناسايي شدند. از اين ميان 13 ايزوله مربوط به نمونه هاي محيطي (7 ايزوله (53/8%) از محيط هاي مرطوب و 6 ايزوله (46/2%) از محيط هاي خشك) و 15 ايزوله نيز مربوط به نمونه هاي باليني (12 ايزوله (80%) از نمونه خلط بيماران و 3 ايزوله (20%) از خون بيماران) بودند. در تعداد اندكي سويه مشترك نيز ميان نمونه هاي باليني و محيطي يافت شد. بر اساس درخت فيلوژني، 28 ايزوله جمع آوري شده مربوط به 21 سويه شناسايي شده از باكتري است كه به دليل شباهت ژنتيكي 100 % برخي از ايزوله ها بوده است. بحث و نتيجه گيري: تمام سويه هاي در حال گردش باكتري استنوتروفوموناس مالتوفيليا در شهر كرمانشاه متعلق به يك الگوي ملكولي خاص بوده و از تنوع ژنتيكي بالايي برخوردار نمي باشند كه احتمال آلودگي بيماران به باكتري را از طريق محيط هاي آلوده بيمارستاني افزايش مي دهد. بنابراين استفاده از روش هاي ملكولي افتراقي با قدرت بالا به عنوان روش قابل قبول در كنترل اين باكتري پيشنهاد مي گردد

aim the molecular similarity of S.maltophilia strains between patients and hospital environments in Kermanshah was studied Methods 500 different clinical and environmental samples were collected and cultured for isolation and identification of S.maltophilia isolates using biochemical tests; then presence of 23srRNA gene was detected by PCR for molecular identification. Finally, by amplifying 7 housekeeping genes (including: atpD، gapA، guaA، mutM، nuoD، ppsA and recA) in relation with S.maltophilia bacterium, the strains of S.maltophilia isolates were determined. Then phylogenetic tree was drawn by Mega 7 software. Results From 500 clinical and environmental samples collected from hospitals, 28 isolates of S.maltophilia were identified by biochemical methods and molecular confirmation. Among these, 13 isolates were obtained from environmental samples and the rest from clinical samples. A small number of common strains were also found between clinical and environmental samples. Phylogenetic tree analysis demonstrated that these 28 isolates belonged to 21 identified strains of the S.maltophilia, which was due to 100% genetic similarity of some isolates. Discussion The molecular similarity of S.maltophilia strains between patients and hospital environment revealed that all strains of this bacterium in Kermanshah belong to a specific molecular pattern and do not have high genetic diversity and probably, this bacterium was transmitted from the hospital to patients. Therefore, observance of hygiene in hospital and employing the molecular methods with high differentiation is recommended to control the distribution of this bacterium.