عنوان مقاله :
غربالگري مولكولي مخمرهاي مولد آستاگزانتين تراوشات درختان توس استان البرز
عنوان به زبان ديگر :
Molecular screening of astaxanthin-producing yeasts of birch sap-flows in Alborz Province of Iran
پديد آورندگان :
اجرلو، فائزه سازمان پژوهش هاي علمي و صنعتي ايران - پژوهشكده زيست فناوري، ايزان , واعظ، محسن سازمان پژوهش هاي علمي و صنعتي ايران - پژوهشكده زيست فناوري، ايزان , همت، جعفر سازمان پژوهش هاي علمي و صنعتي ايران - پژوهشكده زيست فناوري، ايزان
كليدواژه :
مخمر , درختان توس , كاروتنوئيد , آستاگزانتين , واكنش زنجيره‌اي پليمراز چندگانه
چكيده فارسي :
سابقه و هدف: مخمرهاي مولد كاروتنوئيد داراي پراكنش وسيعي در مناطق مختلف دنيا مي‌باشند. در اين بين جداسازي مخمرهاي مولد كاروتنوئيد با ارزش آستاگزانتين تنها از مناطق محدود و زيستگاه‌هاي خاص گزارش شده‌اند. اين مطالعه با هدف بكارگيري روش واكنش زنجيره‌اي پليمراز چندگانه براي غربالگري مولكولي سريعتر جدايه‌ها با توان توليد آستاگزانتين از تراوشات درختان توس استان البرز و بررسي كارآيي آن انجام شد.
مواد و روش‌ها: اين پژوهش بصورت مقطعي با نمونه‌برداري در ارديبهشت ماه 1397 از يكي از رويشگاه‌هاي طبيعي درختان توس گونه بتولا پندولا در استان البرز صورت پذيرفت. پس از جداسازي مخمرها بر روي محيط‌هاي انتخابي و خالص‌سازي كلني‌هايي با رنگ‌هاي متنوع صورتي تا قرمز، اسيدنوكلئيك ژنومي مخمرها استخراج و غربالگري مولكولي جدايه‌ها از نظر قابليت توليد آستاگزانتين با واكنش زنجيره‌اي پليمراز چندگانه بررسي گرديد.
يافته ها: از مجموع 42 كلني واجد رنگدانه در هنگام نمونه‌برداري و جداسازي اوليه، تعداد 23 كلني به رنگ‌هاي صورتي تا قرمز با روش واكنش زنجيره‌اي پليمراز چندگانه مورد ارزيابي قرار گرفتند. از بين اين جدايه‌ها سه مورد مثبت و بقيه منفي تشخيص داده شدند. صحت نتايج با تعيين ترادف ريبوزومي تاييد شد.
نتيجه‌گيري: مطالعه حاضر بيانگر قابليت روش واكنش زنجيره‌اي پليمراز چندگانه در غربالگري مولكولي سريع و مقرون به صرفه جدايه‌هاي مخمري مولد آستاگزانتين و امكان بكارگيري اين روش براي بررسي زيستگاه‌هاي طبيعي ديگر اين مخمرها مي‌باشد.
چكيده لاتين :
Background & Objectives: The carotenoid-producing yeasts have a widespread distribiution worldwide. However, isolation of carotenoid-producing yeasts with valuable astaxanthin have been only reported from limited areas and specific habitats. The aim of this study was to apply the multiple polymerase chain reaction method for faster molecular screening of isolates for the yeasts in the exudation sap from birch trees (Betula pendula Roth.) in Alborz Province of Iran with astaxanthin production capacity and toevaluate its efficiency.
Materials & Methods: This cross-sectional study was carried out by sampling in May 2018 from one of the natural habitats of birch trees Batula Pendula in Alborz Province, Iran. After isolation of yeasts using selected media and purification of yeast colonies with various pink to red colors, yeasts genomic nucleic acids were extracted and molecular screening for astaxanthin-producing detection of isolates was performed by multiple polymerase chain reaction (Multiplex-PCR).
Results: Out of 42 pigmented colonies during sampling and isolation in one cross-sectional study, 23 pink to red colonies were evaluated by Multiplex-PCR method. Of these isolates, three were positive and the rest were negative. The results were validated by determining the ribosomal gene sequencing.
Conclusion: The present study demonstrates the specificity of the multiple polymerase chain reaction method in fast and cost-effective molecular screening of astaxanthin-producing yeast isolates and the applicability of this method to study other natural habitats of these yeasts.
عنوان نشريه :
دنياي ميكروب ها
