تايپينگ مولكولي اشريشياكلي توليد كننده بتالاكتاماز: مقايسهMLVA و PFGE

Home Browse Journal Info Guide for Authors Submit Manuscript Reviewers Contact Us Login فارسي Molecular typing of β -lactamase -producing Escherichia coli: Multiple Locus variable number tandem repeat analysis Versus Pulsed-field gel electrophoresis

سابقه و هدف: اشريشيا كلي توليد كننده بتالاكتاماز مهمترين عامل ايجاد كننده عفونت‌هاي دستگاه ادراري در جامعه و بيمارستان‌ها است. روش‌هاي تعيين تايپ سويه‌ها مانند MLVA و PFGE معمول‌ترين ابزار اپيدميولوژيك نه تنها براي تشخيص انتقال متقاطع پاتوژن‌هاي بيمارستاني بلكه براي تعيين منبع عفونت مي‌باشند. مواد و روشها: اين پژوهش به به منظور ارزيابي قدرت تميز روش‌هاي MLVA و PFGE انجام شد. در مجموع 230 جدايه اشريشيا كلي بدست آمده از بيماران مبتلا به عفونت دستگاه ادراري از نظر حساسيت ضد ميكروبي آزمايش و به منظور مقايسه MLVA و PFGE براي تايپ مولكولي جدايه‌ها مورد بررسي قرار گرفتند. يافته ها: از 230 جدايه، 130 جدايه اشريشيا كلي توليد كننده بتالاكتاماز (56/5%) در اين مطالعه يافت شد. شاخص تنوع لوكوس‌هاي VNTR به ترتيب براي روش 7 و 10 لوكوسي 0/48 و 0/54 تعيين شدند. قدرت تميز PFGE 0/87 محاسبه گرديد. نتيجه گيري: نتايج نشان داد كه قدرت تميز PFGE بيشتر از MVLA است. MLVA روشي مبتني بر PCR است و برخلاف PFGE، داده‌هاي غيرقابل اشتباه توليد مي‌كند. بهينه سازي VNTR پلي مورفيك براي بهبود قدرت تميز MLVA در هر منطقه جغرافيايي ضروري است.

Background & Objectives: β -lactamase -producing E. coli is the most important agent causing urinary tract infections both in community and hospitals. Strain typing including MLVA and PFGE are the most common epidemiologically tools not only for detecting the cross transmission of nosocomial pathogens but also for determining the source of infection. Materials and methods: The present study was carried of for comparison of discriminatory power of MLVA and PFGE methods. A Total of 230 isolates of E. coli from patients with urinary tract infections were examined for identifying and antimicrobial susceptibility testing MLVA and PFGE methods were used for molecular typing of all isolates. Results: Out of 230 isolates, 130 ( 56.5%) β -lactamase -producing E. coli isolates were found in this study. The diversity indices of the VNTR loci showed an average diversity of 0.48 and 0.54 for 7-loci and 10-loci respectively. The discriminatory power of PFGE showed a value of 0.87. Conclusion: Our study showed that PFGE is more discriminatory than MVLA. MLVA is a PCR- based method and generates unmistakable data, in contrast to PFGE. Optimization of polymorphic VNTR is essential to improve the discriminatory power of MLVA basis on geographical region.