شناسايي مولكولي گونه‌هاي Fusarium همراه چمن و برخي درختان در فضاي سبز اردبيل

Molecular identification of Fusarium species associated with turfgrass and some trees in Ardabil greenspace

در بين بيماري‌هاي مختلفي كه گياهان فضاي سبز را تهديد مي‌كنند، جنس Fusarium از اهميت ويژه‌اي برخوردار است. با توجه به اينكه روش‌هاي ريخت‌شناختي در مورد Fusarium علاوه بر زمان‌بر بودن و نياز به تخصص بالا، به‌تنهايي قادر به شناسايي دقيق و قابل اعتماد نيستند، استفاده از آغازگرهاي اختصاصي روشي سريع، مقرون به‌صرفه و بدون نياز به توالي‌يابي است كه مي‌تواند در شناسايي جنس و گونه Fusarium به‌راحتي مورد استفاده قرار گيرد. در اين پژوهش، با توجه به‌ضرورت تاييد مولكولي گونه­ هاي فوزاريوم همراه با زوال درختان زبان گنجشك، اقاقيا، صنوبر و زردي چمن در فضاي سبز اردبيل، علاوه بر راست‌آزمايي دوباره آغازگرهاي اختصاصي گونه با استفاده از جدايه‌هاي استاندارد، گونه جدايه ­هاي فوزاريومي به‌دست آمده از گياهان فضاي سبز با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي شناسايي شدند. در اين پژوهش، تعداد 24 جدايه متعلق به گونه F. solani با استفاده از آغازگرهاي fFuso1 وrfuso2 ، 11 جدايه متعلق به گونه F. oxysporum با استفاده از آغازگرهاي CLOX1-F و CLOX2-R، 10 جدايه متعلق به گونه F. acuminatum با استفاده از آغازگرهاي FAC-F و FAC-R، 8 جدايه متعلق به گونه F. equiseti با استفاده از آغازگرهاي FEF1 و FER1 و 8 جدايه متعلق به گونه F. graminearum با استفاده از آغازگرهاي FgCTPSf024 و FgCTPSrR306 شناسايي شدند. اين آغازگرها هيچ واكنشي با جدايه­ هاي متعلق به ساير گونه ­هاي فوزاريوم مورد بررسي نشان ندادند. ضمناً از سه جدايه منتخب توالي‌يابي شده با آغازگر EF1-fus، دو جدايه به گونه F. solani و يك جدايه به گونه F. redolens تعلق داشتند.

Among the various diseases that threaten the green space plants, the Fusarium genus is of great importance. Due to time consuming, requiring high expertise and low reliability in the morphological methods, it would be recommended to use species-specific primers for identification of Fusarium species as a fast and cost-effective method without need to sequencing that could be easily used to identify the genus and species of Fusarium. In this study, in order to molecularly confirming of Fusarium isolates associated with Ash, Black locust and Populus decline, and turfgrass yellowing, in addition to verifying species-specific primers with standard isolates, Fusarium isolates obtained from Ardabil’s green space plants were identified using these specific primers by PCR. Totally, the 24 isolates belonging to F. solani using fFuso1 and rFuso2, 11 isolates belonging to F. oxysporum species using CLOX1-F and CLOX2-R primers, 10 isolates belonging to F. acuminatum species with using FAC-F and FAC-R primers, 8 isolates belonging to F. equiseti were identified using FEF1 and FER1 primers and 8 isolates belonging to F. graminearum were identified using FgCTPSf024 and FgCTPSrR306 primers. These primers did not react with isolates belonging to other Fusarium species. Also, the sequencing and phylogenetic analysis results lead to identify 2 and 1 isolates as F. solani and F. redolens, respectively.