پديد آورندگان :
بخشي مفرد كاشاني، اشرف دانشگاه علوم پزشكي قزوين - گروه ميكروب شناسي , اصلاني مهر، معصومه دانشگاه علوم پزشكي قزوين - دانشكده پزشكي - مركز تحقيقات ميكروب شناسي پزشكي , عابدي ايلخچي، پريسا دانشگاه علوم پزشكي قزوين - گروه ميكروب شناسي
كليدواژه :
تشخيص آزمايشگاهي , نمونه‌گيري , SARS-CoV-2 , COVID-19 , NAAT
چكيده فارسي :
پيش‌زمينه و هدف: با توجه به شيوع كرونا ويروس جديد SARS-CoV-2)) در سراسر جهان، تشخيص افراد آلوده به اين ويروس و تعيين تيپ‌هاي مختلف آن براي مهار شيوع جهاني بيماري كوويد-19 (COVID-19) بسيار ضروري است. باوجود پيشرفت‌هاي چشمگير در زمينه تشخيص اين بيماري، نتايج حاصل بحث‌برانگيز است، لذا اين مطالعه به بررسي اين چالش‌هاي تشخيصي ازجمله انواع روش‌هاي تشخيص، نوع و زمان نمونه‌گيري و حتي شرايط باليني بيماري مي‌پردازد.
مواد و روش كار: در اين بررسي مروري نظام‌مند، مطالعات انجام‌شده از سال 2003 تا مي 2020 به زبان انگليسي در زمينه چالش‌هاي نمونه‌گيري و تشخيص آزمايشگاهي كرونا ويروس‌ها و ويروس SARS-CoV-2، موردبررسي قرار گرفتند. اين مقالات با جستجوي كلمات كليدي در پايگاه‌هاي اطلاعاتي، PubMed، Scopus و Embace و همچنين موتور جستجوي scholar Google حاصل شدند و مطالعاتي كه در زمينه تشخيص كرونا ويروس‌هاي انساني بود، موردبررسي قرار گرفت و مقالات تكراري از مطالعه حذف گرديد.
يافته‌ها: در جستجوي اوليه، تعداد 98 مقاله استخراج شد كه پس از حذف موارد تكراري و ارزيابي عنوان و چكيده، درنهايت تعداد 64 مقاله شرايط لازم جهت بررسي را دارا و وارد مطالعه گرديد.، نتايج مطالعات نشان داد كه، اگرچه روش RT-PCR استاندارد طلايي براي تشخيص بيماري كوويد-19 مي‌باشد، اما براي ارزيابي صحيح نمونه، به غلظت كافي از RNA ويروسي در نمونه بيمار نياز دارد. ازآنجايي‌كه غلظت RNA ويروسي در نمونه بيمار ثابت نيست، اين امر مي‌تواند در نتايج به‌دست‌آمده تأثيرگذار باشد. همچنين عواملي مانند نوع نمونه، زمان نمونه‌گيري، كيفيت نمونه ازنظر مواد سلولي و نحوه ارسال و نگهداري نمونه در آزمايشگاه به‌شدت مي‌تواند روي غلظت RNA تأثير بگذارد و گاهي منجر به نتايج منفي كاذب گردد. اگرچه بهترين نمونه جهت شناسايي ويروس در روزهاي نخستين، سواب نازوفارنكس و در روزهاي آتي، نمونه‌هاي گرفته‌شده از دستگاه تنفس تحتاني مي‌باشد وليكن نمونه‌هاي متعددي همچون سواب گلو و مدفوع نيز مي‌تواند جهت شناسايي استفاده شود ولي درصد جداسازي RNA ويروسي در اين نمونه‌ها به‌طور قابل‌توجهي كاهش مي‌يابد.
بحث و نتيجه‌گيري: با توجه به گستردگي جهاني بيماري كوويد-19، بيماريابي و تشخيص زودهنگام بيماران و افراد مشكوك، قرنطينه و درمان به‌موقع آنان، در كنترل همه‌گيري از اهميت بالايي برخوردار مي‌باشد. استفاده از تست‌هاي تشخيصي صحيح به پزشكان اين امكان را مي‌دهد تا مداخلات فوري را براي بيماران انجام دهند. لذا انتخاب روش آزمايشگاهي و نمونه‌گيري صحيح و انتقال مناسب داراي اهميت زيادي مي‌باشد. اگرچه در تشخيص دقيق بيماري كوويد-19 تشخيص مولكولي بهترين روش تشخيصي است وليكن مطالعات نشان مي‌دهد بهتر است به نتايج حاصل از يك آزمايش بسنده نكرده و براي رفع چالش‌هاي تشخيصي از تركيب روش‌ها و آزمايشات مختلف استفاده شود.
چكيده لاتين :
Background & Aims: Given the prevalence of SARS-CoV-2 worldwide, it is essential to identify people
infected with the virus and determine its different types to control the global outbreak of COVID-19.
The results of the studies are controversial, so this study examines these diagnostic challenges, including
the types of diagnostic methods, the type and time of sampling, and even the clinical condition of the
disease.
Materials & Methods: In this systematic review, studies conducted from 2003 to May 2020 in English
on the challenges of laboratory sampling and diagnostics of coronaviruses and SARS-CoV-2 virus were
reviewed. These articles were obtained by searching for keywords in databases, PubMed, Scopus and
Embace as well as Google scholar search engine and duplicate articles were removed from the study.
Results: In the initial search, 98 articles were extracted that after eliminating duplicates and evaluating
the title and abstract, finally 64 articles had the necessary conditions for review and were included in
the study. The results of the studies showed that, although RT-PCR is the gold standard for the diagnosis
of Covid-19 disease, but it requires a sufficient concentration of viral RNA in the patient sample for
proper evaluation of the sample. Since the concentration of viral RNA in the patient sample is not
constant, this can affect the results obtained. Although the best sample to detect the virus in the first
days is the nasopharyngeal swab and in the following days, samples taken from the lower respiratory
tract, but also numerous samples such as throat swabs and feces can also be used for identification.
However, the percentage of viral RNA isolation in these samples is significantly reduced.
Conclusion: Due to the global prevalence of Covid-19 disease, early diagnosis of patients, quarantine
and timely treatment are of great importance in controlling the epidemic. The use of correct diagnostic
tests allows physicians to perform immediate interventions for patients. Although molecular diagnosis
is the best method, studies show that it is better not to be satisfied with the results of an experiment and
to use a combination of different methods and tests to solve diagnostic challenges.
