پديد آورندگان :
غفوري، فرزاد دانشگاه تهران - پرديس كشاورزي و منابع طبيعي - گروه علوم دامي ، كرج، ايران , صادقي، مصطفي دانشگاه تهران - پرديس كشاورزي و منابع طبيعي - گروه علوم دامي ، كرج، ايران , بهرامي، ابوالفضل دانشگاه تهران - پرديس كشاورزي و منابع طبيعي - گروه علوم دامي ، كرج، ايران , عبدالهي آرپناهي، رستم دانشگاه جورجيا - دانشكده كشاورزي و علوم محيط زيست - گروه علوم دامي - جورجيا، ايالات متحده آمريكا , جوانمرد، آرش دانشگاه تبريز - دانشكده كشاورزي - گروه علوم دامي، تبريز، ايران , ميرائي آشتياني، رضا دانشگاه تهران - پرديس كشاورزي و منابع طبيعي - گروه علوم دامي ، كرج، ايران
كليدواژه :
آندومتريوم , گاوهاي هلشتاين , باروري , ترانسكريپتوم , جسم زرد
چكيده فارسي :
انتخاب ژنتيكي براي افزايش توليد شير و سودآوري اقتصادي در صنعت گاوهاي شيري با كاهش عملكرد توليدمثلي از جمله كاهش زنده‌ماني رويان و افزايش از دست رفتن آبستني همراه بوده است. در پژوهش حاضر، هدف اصلي، استفاده از پروفايل ترانسكريپتوم بافت آندومتريوم و جسم زرد دو دسته از گاوهاي شيري هلشتاين با باروري بالا و پايين، به منظور شناسايي ژنهاي مؤثر در حفظ باروري به‌ويژه اوايل دوره آبستني است. در تجزيه داده‌هاي RNA-Seq براي مقايسه بيان ژني، 4538 ژن استخراج شد كه در مجموع 1466 ژن تفاوت بياني معني‌داري نشان دادند (P<0.000001, Fold change<0.5). سپس با مقايسه ژنهاي مربوطه در ميان پروفايل‌هاي ترانسكريپتوم، ژنهاي مشترك بين بافت آندومتريوم (روزهاي هفت و 13 چرخه فحلي) و جسم زرد (در روز 13 چرخه فحلي) شامل ژنهاي SYNM، PARM1، NXPE2، NT5DC3، COL4A3، COL12A1، ALPK3، ADAMDEC1، SERPINA14، S100A9، PI16، OAS1X، MSTN، MASP1، CD83، CA2، C2، C5، JSP.1 و SAA3 مشخص شدند. بررسي نتايج حاشيه‌نويسي اين ژن‌ها ثابت كرد كه در فرآيند اصلي مسيرهاي متابوليك و سيگنالينگ مرتبط با سيستم حمل‌و‌نقل يوني، التهاب، عملكرد سيستم ايمني بدن و ساختار ماتريس سلولي داراي نقش مي‌باشند. پژوهش حاضر مي‌‌تواند بينش جديدي از شواهد مولكولي در راستاي سازوكارهاي زيستي پروفايل ترانسكريپتوم در محيط رحم و بيوماركرهاي مرتبط با باروري در گاوهاي شيري ارائه دهد.
چكيده لاتين :
Genetic selection for increasing milk production and economic profitability in the dairy industry has been associated with reduction in reproductive performance, including lower embryo survival and pregnancy loss. The main purpose of this study was to use the transcriptome profiles of endometrial tissue and Corpus luteum of two groups of high and low fertility Holstein dairy cows to identify genes that are effective in reproductive rate, especially in early pregnancy. By the analysis of RNA-Seq data to express the gene differences, 4538 genes were extracted, which a total of 1466 genes showed significant expression differences (P<0.000001, Fold change<0.5). Then, by comparing the relevant genes among transcriptome profiles, common genes between endometrial tissue (on days 7 and 13 of the estrous cycle) and Corpus luteum (on day 13 of the estrous cycle) including SYNM, PARM1, NXPE2, NT5DC3, COL4A3, COL12A1, ALPK3, ADAMDEC1, SERPINA14, S100A9, PI16, OAS1X, MSTN, MASP1, CD83, CA2, C2, C5, JSP.1 and SAA3 were identified. Annotation results of these genes indicated that they have a role in the main process of metabolic and signaling pathways related to the ion transport system, inflammation, immune system function, and cell-matrix structure. Overall, the present study can provide new insights into the molecular evidence for the biological mechanisms of transcriptome profiling in the uterine environment and biomarkers related to fertility in dairy cows.
