عنوان مقاله :
انتقال دهنده پلي آمين ATP13A2 و كوويد 19: يك مطالعه مبتني برداده هاي ريز آرايه وآناليز عملكرد
عنوان به زبان ديگر :
Polyamine transporter ATP13A2 and Covid-19: a microarray assay-based and functional analysis study
پديد آورندگان :
عليپور، محسن دانشگاه علوم پزشكي جهرم - گروه علوم و فناوري هاي نوين پزشكي - گروه بيوشيمي، جهرم، ايران , روستازاده، اباذر دانشگاه علوم پزشكي جهرم - مركز تحقيقات بيماري هاي غيرواگير - گروه علوم و فناوري هاي نوين پزشكي - گروه بيوشيمي، جهرم، ايران
كليدواژه :
كوويد- 2 , ريز آرايه , ATP13A2 , تحليل عملكرد
چكيده فارسي :
مقدمه : پاندمي كوويد 19 عده كثيري را مبتلا نموده و متاسفانه موجب مرگ و مير بسياري نيز شده است. مكانيسم دقيق عمل ويروس عامل آن در بدن مشخص نيست. هدف از مطالعه كنوني بررسي و آناليز داده هاي ريز آرايه و بررسي عملكرد بود تا بتوانيم به مكانيسم هاي جديد نحوه عملكرد اين ويروس در سلول هاي انسان دست يابيم.
روش كار: داده هاي ريزآرايه استخراج شده از NCBI توسط GEO2R و نرم افزار R مورد آناليز قرار گرفت. ژن هايي كه افزايش بيان و كاهش بيان داشتند استخراج شدند و سپس آناليز عملكرد در مورد آنها صورت گرفت .
يافته ها : . نتايج نشان داد كه در سطح لگاريتم پايه دو تغيير بيان بزرگتر از 3 و كوچكتر از 3- ترانس كريپتوم، 319 و 573 ژن افزايش بيان يافته به ترتيب در گروه بيماران كوويد خفيف و كوويد شديد وجود دارند. همچنين 156 و 590 ژن كاهش بيان يافته به ترتيب در گروه بيماران كوويد خفيف و كوويد شديد وجود دارند. نتايج GO نشان داد كه الگوي ژن هاي تفاوت بيان يافته در گروه بيماران كوويد با فرم شديد با ژن ATP13A2 مرتبط است.
نتيجه گيري : ويروس كوويد 19 احتمالا در تعامل با عواملي چون ATP13A2 شرايط بقاي خود در داخل سلول را تنظيم مي نمايد.
چكيده لاتين :
Introduction: Unfortunately, a lot of people infected with and died due to covid-19. The exact mechanism of causative virus in human body is unknown. The aims of the study were to survey and analysis the microarray data and to perform functional analysis to unveil the new mechanisms of this virus in regarding to human cells.
Methods: NCBI microarray extracted data were analyzed by GEO2R and R package. Up- and down-regulated genes were extracted and functional analysis was performed.
Results: results showed that in Log of expression greater than 3 and lesser than -3 of transcriptome, there were 319 and 573 up-regulated genes in mild and severe covid-19 patients, respectively. Also there were 156 and 590 down-regulated genes in mild and severe covid-19 patients, respectively. GO analysis showed that deferentially expressed gene pattern in severe covid-19 patients is related to ATP13A2
Conclusion: Covid-19 probably regulates its vitality in human cells through interplay with factors such as ATP13A2
عنوان نشريه :
مجله علوم پزشكي پارس
