بررسي بيان ژن هاي HOTAIR و HOXC13 در بافت هاي توموري و نرمال حاشيه تومور در بيماران مبتلا به سرطان مري

Evaluation of HOTAIR and HOXC13 Genes in Tumor an‎d Normal Tissues Adjacent to Tumor in Patients with Esophageal Cancer

زمينه و هدف اسيدهاي ريبونوكلييك غير كدكننده طولاني يكي از مولكول هايي هستند كه با پيشرفت سرطان همراهي دارند. HOTAIRعضوي از خانواده اسيدهاي ريبونوكلييك غير كدكننده طولاني است. ژن HOXC13 يكي از چندين ژن هاكس است كه در نزديكي ژنHOTAIR قرار گرفته است. مطالعه حاضر با هدف بررسي بيان ژن HOTAIR و HOXC13 در بافتهاي توموري سرطان مري و نرمال حاشيه تومور انجام شد. روش بررسي اين مطالعه تجربي است. 30 جفت بافت تومور مري و بافت حاشيه تومور آن خريداري شد، اسيد ريبونوكلييك اين بافت ها استخراج مي شود و براي بررسي بيان نسبي آنها از روش ريل تايم پي سي آر به همراه ژن بتا اكتين استفاده شد. براي آناليز آماري داده هااز آزمون آماري تي تست و تحليل واريانس و با نسخه 8 نرم افزار گراف پدپريسم انجام شد. يافته ها مقايسه ميزان بيان ژن هدف در نمونه هاي توموري مري نسبت به حاشيه تومور نشان داد بيان نسبي ژن 1/95 HOTAIR برابرP= 0/0219و 14/4 HOXC13 برابر(014 / P= 0) به طور معنادار افزايش بيان وجود دارد. همچنين بيان ژن HOXC13 با متاستاز به نواحي دور، نوع و درجه تومور رابطه معناداري را نشان مي دهد. ضريب همبستگي ميان بيان نسبي ژن هاي HOTAIR و ،HOXC130/152 به دست آمد كه ميان اين دو ژن همراهي مثبت بود، اما معنادار نبود(2/ P= 0) نتيجه گيري با توجه به ارتباط دو ژن HOXC13 و HOTAIR با سرطان، اين مطالعه تا حدي مي تواند بيان كننده نقش اين دو ژن در فرآيندتومورزايي در گسترش سرطان مري باشد.

Background and Objectives One of the molecules that associated with cancer progression are Long non coding RNA (LncRNAs). HOX transcript antisense RNA (HOTAIR) is a member of the lncRNA family. Homeobox C13 (HOXC13) gene is one of the several HOX genes that is located near the HOTAIR. This study was to evaluate the expression of HOTAIR and HOXC13 genes in tumor and normal tissues adjacent to tumor in patients with esophageal cancer. Methods This is an experimental study. 30 pairs of esophageal tumor tissue and tumor margin tissue were purchased. RNA of these tissues was extracted and Real-time PCR with Beta-actin gene was used for their relative expression. Statistical analysis of data, t-test and Analysis of variance (ANOVA) were performed in GraphPad Prism 8 software. Results Comparison of target gene expression in esophageal tumor samples relative to tumor margins showed that the relative expression of the HOTAIR genes was 1.95 time (P=0.0219) and the HOXC13 14.4 time (P=0.014) significantly increased expression. Also, the HOXC13 gene expression shows a significant relationship with metastasis to distant regions, type and degree of tumor. The correlation coefficient between the relative expression of the HOTAIR and the HOXC13 genes was 0.152. It was positive but not significant between the two genes (P=0.2). Conclusion According to the association of the HOTAIR and the HOXC13 genes with cancer, our study may partially express the role of these two genes in the tumorigenesis process in the development of esophageal cancer.