بررسي عارضه اختلال در غلاف‌بندي سويا با رهيافت‌هاي پروتئوميك و بيوانفورماتيك

مقدمه و هدف: عارضه اختلال در غلاف‌بندي نوع ويژه اي از رشد همراه با ناهنجاري در تشكيل گل و غلاف است كه در آن گياهان سويا مدت ها پس از رسيدگي غلاف ها، سبز باقي مي مانند و منجر به كاهش شديد عملكرد مي‌گردد. به منظور بررسي و شناسايي پروتئين‌هاي دخيل در تظاهر عارضه اختلال در غلاف‌بندي سويا، پروفايل بيان پروتئين هاي گياهان سالم و مبتلا به عارضه اختلال در غلاف‌بندي سويا در دو رقم كتول و گرگان 3 بر اساس رهيافت‌هاي پروتئوميك و بيوانفورماتيك مورد مقايسه قرار گرفتند. مواد و روش‌ها: براي اين منظور نمونه هاي برگي گياهان سالم و مبتلا از دو رقم فوق در مرحله گلدهي انتخاب و پروتئين آنها به روش TCA/Acetone استخراج شد. سپس تفكيك پروتئين ها و تجزيه افتراقي آنها به ترتيب با استفاده از ژل الكتروفورز دو بُعدي و طيف‌سنجي جرمي nESI-LC-MS/MS انجام شد. يافته‌ها: تجزيه و تحليل نتايج ژل الكتروفورز دو بُعدي نشان داد كه سطح بيان 5 تا از 155 لكه پروتئيني در رقم كتول و 11 تا از 143 لكه پروتئيني در رقم گرگان 3 در گياهان سالم و مبتلا به طور معني داري تغيير يافت. آناليز افتراقي پروتئين ها با تغيير بيان معني دار باnESI-LC-MS/MS نشان داد كه در پاسخ به اين عارضه بيشتر پروتئين هاي درگير در فعاليت هاي تنظيم سلولي، توليد انرژي، متابوليسم، انتقال سيگنال، نسخه برداري و ترجمه ژن و نيز تقسيط و ذخيره‌سازي پروتئين ها شركت دارند. نتيجه‌گيري: در ميان پروتئين هاي شناسايي شده احتمالا پروتئين هاي 14-3-3 like protein، OEE2 ، زير واحد بزرگ رابيسكو و پروتئين NACA ممكن است از جمله تنظيم كننده هاي كليدي عارضه اختلال در غلاف‌بندي سويا باشند.