مطالعه بيوانفورماتيك و روابط فيلوژنتيك جدايه‌هاي ايراني باكتري باسيلوس تورينجينسيس با استفاده از توالي ژن SrDNA16 16

سابقه و هدف: باكتري گرم مثبت باسيلوس تورينجينسيس بلور‌هاي پروتين‌ با خاصيت حشره‌كشي توليد ‌مي‌كند. تحليل توالي‌هاي كوچك ژنrDNA  براي مطالعه تكامل و رده‌بندي موجودات زنده به‌كار‌ مي‌رود. اين مطالعه با استفاده از تكنيك واكنش زنجيره‌اي پليمراز ‌روي توالي S Rdna 16 از پنج جدايه‌ بومي باسيلوس تورينجينسيس انجام‌ شد. مواد و روشها: بررسي ويژگي‌ها و روابط فيلوژنتيك ميان پنج توالي جدايه‌هاي بومي همراه با جدايه‌هاي ديگر موجود در بانك ژن و ساير گونه‌هاي جنس باسيلوس، با نرم‌افزار مسكوئيت و پايگاه leBIBIQBPP انجام‌ شد. يافته ها: پنج جدايه بومي به ميزان 92/06 تا 99/93 درصد با يكديگر و به ميزان 99/73 تا ۱۰۰ درصد با ساير جدايه‌هاي باسيلوس تورينجينسيس شباهت داشتند. درخت فيلوژنتيك نشان ‌داد Bt 1019،Bt 1020  وBt 1039  در گروه اول وBt 1001  وBt 1091  در گروه دوم قرار‌گرفتند. بر اساس تحليل تواليBt 1001  با كمك leBIBIQBPP، كمترين فاصله با با‌سيلوس فريگوريتولرانس بدست ‌آمد، همچنين تواليBt 1091  نيز بيشترين شباهت را با باكتري مذكور نشان‌ داد. توالي باسيلوس آنتراسيس به Bt 1019 نزديك بود. تواليBt 1020  بيشترين نزديكي را با باسيلوس سرئوس داشت. در مورد Bt 1039 علاوه بر باسيلوس سرئوس، كمترين فاصله با باسيلوس ماركورستينكتوم مشاهده ‌شد. نتيجه گيري: بلور‌هاي پروتيني در باكتري‌هاي بومي مشاهده ‌شدند. بلاست توالي ژن S rDNA 16 در جدايه‌هاي بومي بيشترين شباهت را به جدايه‌هاي باسيلوس تورينجينسيس موجود در بانك ژن نشان ‌داد. همچنين به دليل استخراج بلورهاي سم از جدايه ها، نتايج پيش‌بيني‌ كرد سه جدايه بومي Bt 1019،Bt 1020   وBt 1039  عليه آفات بالپولكداران و دو جدايهBt 1001  وBt 1091  عليه آفات سخت‌ بالپوش مي‌توانند موثر و سمي باشند.