شناسايي و بررسي تنوع‌ژنتيكي استرين‌هاي بيماري‌زاي سودوموناس جداشده از ميزبان‌هاي فلفل، پياز و سيب‌زميني در استان‌هاي آذربايجان‌شرقي و غربي

بيماري‌ پوسيدگي باكتريايي فلفل، پياز و سيب‌زميني يكي از بيماري‌هاي مهم در استان‌هاي آذربايجان‌شرقي و غربي است، كه شناسايي دقيق عوامل اين بيماري‌ و بررسي تنوع ژنتيكي آن‌ها مي‌تواند در پيشگيري از وقوع اين بيماري‌ها مفيد باشد. در تحقيق حاضر سعي مي ‌شود علاوه بر مطالعه و شناسايي فنوتيپي بيوشيمايي و مولكولي، به مطالعه‌ي تنوع ژنتيكي گونه‌هاي باكتريايي از اين ميزبان‌هاي منتخب در استان‌هاي آذربايجان‌شرقي و غربي پرداخته شود تا اطلاعات كاملي در اين خصوص حاصل گردد. بدين منظور در فصول بهار و تابستان سال‌هاي 1398 و 1399 نمونه‌برداري از گياهان مزبور صورت گرفت. از كشت نمونه‌هاي جمع آوري شده، در كل 59 جدايه به عنوان باكتري‌هاي بيماري‌زا جداسازي شدند. براساس نتايج آزمون‌هاي فنوتيپي، همه استرين‌ها گرم منفي و كاتالاز مثبت و هوازي اجباري بوده و توليد رنگدانه فلورسنت در محيط كشت KB كردند و به عنوان جنس سودوموناس شناسايي شدند. بيماري‌زايي استرين‌ها پس از گذشت دو هفته روي ميزبان سالم، اثبات گرديد. تنوع استرين‌ها با مقايسه ويژگي‌هاي فنوتيپي، انگشت‌نگاري  ژنتيكي حاصل از BOXPCR و ERICPCR با يكديگر ارزيابي گرديد. براساس انگشت‌نگاري  ژنتيكي حاصل از اين دو روش، استرين‌هاي سيب‌زميني به 5 گروه و استرين‌هاي جداشده از پياز و فلفل به 4 گروه تقسيم شدند. اين نتايج نشان دهنده تنوع ژنتيكي بالا بين استرين‌ها بود. براساس توالي يابي ژن هاي 16S rRNA، gyrB و rpoD، استرين‌هاي جداشده از ميزبان‌هاي سيب‌زميني، پياز و فلفل به عنوان گونه Pseudomonas marginalis شناسايي شدند. با بررسي منابع موجود، تحقيق حاضر اولين گزارش از جداسازي، شناسايي و بررسي تنوع ژنتيكي اين استرين‌ها از ميزبان‌هاي فلفل، سيب‌زميني و پياز در استان‌هاي آذربايجان‌شرقي و غربي مي‌باشد.