عنوان مقاله :
بررسي نظري اثر ايزوتوپي سينتيكي بر روي واكنش كاتاليستي آنزيم گلياكسالازI از باكتري ايشريچياكولاي
پديد آورندگان :
حسيني ، خالد دانشگاه كردستان - دانشكده علوم پايه - گروه شيمي , فرشيدفر ، بهناز دانشگاه كردستان - دانشكده علوم پايه - گروه شيمي , ايراني ، مهدي دانشگاه كردستان - دانشكده علوم پايه - گروه شيمي
كليدواژه :
آنزيم گلياكسالاز I , اثر ايزوتوپي سينتيكي , سازوكار , نظريه تابعي چگالي
چكيده فارسي :
در اين پژوهش از نظريه تابعي چگالي براي مطالعه اثر ايزوتوپي سينتيكي روي واكنش كاتاليستي انانتيومر S سوبستراي آنزيم گلياكسالاز I از باكتري اشريشياكلي استفاده شده است. مدلسازي جايگاه فعال، بر اساس ساختار كريستالي آنزيم، با استفاده از روش كوانتوم كلاستر انجام شد. ساختار نقاط ايستا در طول مسير واكنش بهينه و انرژي مولكولها محاسبه شدند. اثر حلال روي نيمرخ انرژي پتانسيل با مدل CPCM محاسبه گرديد. نتايج نشان ميدهند، هنگامي كه اتم H1 (اتم هيدروژن متصل به كربن كايرال سوبسترا) با دوتريم جايگزين ميشود، انرژي حالتهاي گذار اول و دوم نسبت به واكنشگر و حدواسط اول به مقدار كمتري كاهش مييابد، به طوري كه انرژي فعالسازي افزايش مييابد و مقدار kH/kD بزرگتر از 2 به دست ميآيد (اثر ايزوتوپي سينتيكي نوع اول مشاهده ميشود). اين نتيجه، در توافق با مكانيسم واكنش كاتاليستي آنزيم گلياكسالاز I است كه در آن شكستن پيوند C1 H1 در مرحله تعيين كننده سرعت قرار دارد. همچنين مشخش شد كه با جايگزيني اتم H2 (هيدروژن گروه الكلي سوبسترا) با دوتريم، انرژي حالتهاي گذار اول و دوم به اندازهاي كاهش مييابند كه مقدار kH/kD كمتر از 1 به دست آيد و اثر ايزوتوپي معكوس مشاهده ميشود.
عنوان نشريه :
پژوهش هاي شيمي
عنوان نشريه :
پژوهش هاي شيمي