بررسي مجموعه هاي ژني و مسيرهاي زيستي مرتبط با برخي صفات بيومتري در گوسفند

زمينه مطالعاتي: شناسايي ژن‌‌هاي بزرگ اثر مؤثر بر صفات مهم اقتصادي يكي از مهم‌‌ترين اهداف اصلاح نژادي در پرورش گوسفند است. هدف: پژوهش حاضر با هدف مطالعه پويش ژنومي بر اساس آناليز مجموعه‌‌هاي ژني براي شناسايي جايگاه‌‌هاي ژني مؤثر بر وزن تولد و صفات بيومتري با استفاده از آرايه‌‌هاي ژنومي با تراكم بالا بوده است. روش‌ كار: بدين منظور از اطلاعات ركورد‌هاي فنوتيپي و ژنوتيپي مرتبط با وزن تولد (BW)، طول بدن، (BL) ارتفاع قد از جدوگاه (WH) و دور سينه (CG) 277 نمونه‌‌ از گوسفند لوزهانگ استفاده شد. ابتدا آناليز پيوستگي براي وزن تولد و صفات بيومتري در برنامه GEMMA انجام شد. سپس با استفاده از بسته نرم افزاري biomaRt2 ژن‌هاي معني‌داري كه در داخل و يا 25 كيلوباز بالا و پايين دست نشانگرهاي معني‌دار قرار داشتند، شناسايي گرديد. در نهايت تفسير مجموعه ژني با بسته نرم افزاري goseq برنامه R با هدف شناسايي عملكرد بيولوژيكي ژن‌‌هاي نزديك به مناطق انتخابي و ژن‌‌هاي كانديدا از طريق پايگاه‌‌هاي GO، KEGG، DAVID و PANTHER انجام شد. نتايج: در اين پژوهش تعداد 14 نشانگر تك نوكلئوتيدي واقع روي كروموزوم‌‌‌هاي 2، 3، 5، 7، 11، 13، 17، 19، 20 و 25 شناسايي شدند كه با ژن‌‌هاي ‌MYL1، MYL3، ACACA (BW)،‌PLCB1 ، BMPR1A، LRPPRC، PTBP1، TMEM117 (BL)، ADIPOR2، SYN3، TRAK1 (WH) و PPARG، HMGA1 (CG) مرتبط بودند. در تفسير مجموعه ژني تعداد 21 مسير هستي شناسي ژني و بيوشيميايي با صفات وزن تولد و بيومتري شناسايي شد (P˂0.05). از اين بين، مسيرهايmuscle structure development ، carbohydrate derivative metabolic process، anatomical structure formation involved in morphogenesis، skeletal system development، positive regulation of ossification، muscle cell proliferationو GnRH signaling pathway عملكرد‌هاي مهمي را در ارتباط با رشد و توسعه عضلات اسكلتي، هموستازي گلوكز، فرآيند استخوان‌سازي، تنظيم يون كلسيم و فعال‌سازي مسير سيگنال‌دهي MAPK بر عهده داشتند. نتيجه ‌گيري نهايي: با توجه به تأييد نتايج حاصل از مطالعه قبلي در زمينه پويش ژنومي وزن تولد و صفات بيومتري و شناسايي مناطق ژنومي جديد استفاده از يافته‌هاي اين تحقيق مي‌تواند در انتخاب ژنتيكي برنامه‌هاي اصلاح نژادي گوسفند مفيد باشد.