طراحي يك سازه جديد واكسن مولتي اپي توپ پپتيدي عليه SARS-CoV-2 با استفاده از ابزار ايمونوانفورماتيك

مقدمه و هدف: ويروس سندرم تنفسي حاد كرونا ويروس (SARS-CoV-2) براي اولين بار در چين ظهور پيدا كرد و به سرعت در سراسر جهان منتشر شد. به دليل شيوع گسترده آن در سراسر جهان تلاش براي ارائه واكسن موثر و ايمن عليه اين ويروس ضروري مي باشد. ژنوم اين ويروس داراي مولكول RNA تك رشته اي مي‌باشد كه كدكننده چهار پروتئين ساختاري متفاوت مي‌باشد، از ميان آنها، پروتئين هاي اسپايك (S) و نوكلئوكپسيد ويروس (N) نقش بسزايي در تحريك سيستم ايمني در جهت مقابله با ويروس را دارند. واكسن هاي مولتي اپي توپ پپتيدي كه شامل اپي توپ هاي ايمني زاي سلول هاي T و B هستند، به دليل اختصاصيت بالا در سال هاي اخير بسيار مورد توجه واقع شده اند. اين واكسن ها با استفاده از ابزار ايمونوانفورماتيك طراحي مي‌شوند. مواد و روش ها: در اين پژوهش پروتئين هاي S و N  SARS-CoV-2 با كمك سرورهاي بيوانفورماتيك به منظور شناسايي اپي توپ‌هاي سلول هاي T CD4 و B آناليز شدند. از زير واحد B توكسين كلرا و اپي توپ PADRE به عنوان ادجوانت استفاده شد. اجزاي مذكور با لينكرهاي پپتيدي به هم متصل شدند و ويژگي هاي سازه واكسن طراحي شده از جمله آنتي ژنيسيته، عدم آلرژنيسيته، خصوصيات فيزيكي و شيميايي، ساختار دوم و سوم با استفاده از سرورهاي بيوانفورماتيك پيشگويي شد.نتايج: براساس نتايج آناليزهاي بيوانفورماتيك سازه مذكور داراي آنتي ژنيسيته بالا بوده و آلرژن نيز نمي‌باشد. نتيجه‌گيري: بنابراين سازه طراحي شده به عنوان يك كانديد واكسن مناسب عليهSARS-CoV-2 مي‌تواند مورد بررسي قرار گيرد، هر چند انجام مطالعات آزمايشگاهي ضروري مي‌باشد.