عنوان مقاله :
روابط ژنتيكي بين گونه‌ها و ارقام جنس پسته (Pistacia L.) به‌وسيله نشانگر SCoT
پديد آورندگان :
سعدلو پاريزي ، محسن دانشگاه محقق اردبيلي - دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي - گروه مهندسي توليد و ژنتيك به‌نژادي , جهانبخش گده كهريز ، سدابه دانشگاه محقق اردبيلي - دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي - گروه مهندسي توليد و ژنتيك به نژادي , دشتي ، حسين دانشگاه ولي‌عصر (عج) رفسنجان - دانشكده كشاورزي - گروه ژنتيك و توليد گياهي , صابري ريسه ، روح اله دانشگاه ولي‌عصر (عج) رفسنجان - دانشكده كشاورزي - گروه گياه‌پزشكي , هاشمي نسب ، حجت سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - مؤسسه تحقيقات علوم باغباني - پژوهشكده پسته
كليدواژه :
پسته , تجزيه خوشه‌اي , فيلوژنتيك , نشانگرهاي مولكولي , نشانگر SCoT
چكيده فارسي :
هدف: پسته يكي از مهم‌ترين محصولات كشاورزي مي‌باشد و كشور ايران داراي غني‌ترين ژرم‌پلاسم پسته دنياست. وجود اين ذخاير ژنتيكي فرصتي مناسب جهت استفاده براي اهداف اصلاحي خواهد بود. آگاهي از روابط ژنتيكي بين ژنوتيپ‌هاي پسته نقش مهمي در برنامه‌هاي اصلاحي آن دارد. نشانگرهاي مولكولي يكي از ابزارهاي قدرتمند جهت بررسي روابط فيلوژنتيك گياهان مي‌باشند. تكنيك SCoT يكي از سيستم‌هاي مولكولي است كه جهت بررسي ارتباط ژنتيكي گونه‌ها و ارقام مختلف گياهي كاربرد دارد. اين مطالعه به منظور ارزيابي روابط ژنتيكي تعدادي از گونه‌ها و ارقام جنس پسته با استفاده از نشانگر مولكولي SCoT و بررسي سودمندي اين نشانگر در تمايز ژنوتيپ‌هاي اين جنس انجام شد.مواد و روش‌ها: مواد گياهي اين مطالعه شامل 29 ژنوتيپ از گونه‌هاي اهلي و وحشي جنس پسته است. 25 آغازگر از نشانگر SCoT جهت ارزيابي روابط ژنتيكي مورد استفاده قرار گرفت. DNA ژنومي از نمونه‌هاي برگي با استفاده از روش CTAB با اندكي تغيير استخراج گرديد. كميت و كيفيت DNA استخراج‌شده به وسيله اسپكتروفتومتر و الكتروفورز ژل آگاروز تعيين گرديد. تجزيه خوشه‌اي بر اساس ماتريس تشابه ژاكارد و الگوريتم اتصال كامل و تجزيه به مؤلفه‌هاي هماهنگ اصلي، با استفاده از نرم‌افزار 2.02e NTSYSpc انجام شدند. نتايج: در مجموع 449 قطعه DNA توسط آغازگرها تكثير گرديد كه 433 باند (96.43 درصد) چندشكل بودند. متوسط تعداد قطعات تكثيري براي هر آغازگر 17.96 باند با ميانگين 17.32 باند چندشكل در هر آغازگر بود. تعدادي نشانگر اختصاصي گونه نيز در بعضي ژنوتيپ‌ها آشكار گرديد. مقادير ميانگين محتواي اطلاعات چندشكلي از 0.18 تا 0.38 متغير بود. همچنين مقادير شاخص نشانگري در محدوده 0.56 تا 4.36 قرار داشت. دامنه ضرايب تشابه ژنو تيپ‌ها بين 25 تا 68 درصد متغير بود. تجزيه خوشه‌اي، ژنوتيپ‌هاي پسته را به دو شاخه اصلي شامل گونه ورا (اهلي) و گونه‌هاي وحشي تقسيم نمود. تجزيه به مؤلفه‌هاي هماهنگ اصلي، گونه ورا را از گونه‌هاي وحشي تفكيك و نتايج تجزيه خوشه‌اي را تأييد نمود.نتيجه‌گيري: نتايج اين مطالعه نشان داد كه نشانگر مولكولي SCoT چندشكلي بالايي را در بين گونه‌ها و ارقام پسته آشكار و ژنوتيپ‌هاي موردمطالعه را از يكديگر متمايز ساخت. بنابراين، نشانگر SCoT ابزاري سودمند جهت مطالعه روابط فيلوژنتيك در جنس پسته است.
عنوان نشريه :
بيوتكنولوژي كشاورزي
عنوان نشريه :
بيوتكنولوژي كشاورزي
