تنوع ژنتيكي قارچ‌هاي اندوفيت درختچه شيرخشت (‏Cotoneaster integerrimus Medik.‎‏) ارسباران‏

قارچ هاي اندوفيت گياهي نقش مهمي در فعل و انفعالات فيزيولوژيكي و بيوشيميايي گياهان در پاسخ به شرايط محيطي ايفا مي كنند. در همين راستا، شناسايي قارچ هاي اندوفيت گونه شيرخشت در ارسباران هدف گذاري شد. نمونه هاي برگ و ساقه از گياه مذكور جداسازي و پس از ضدعفوني سطحي، در محيط كشت PDA حاوي استرپتومايسين كشت شدند. پس از رشد هيف هاي قارچي و واكشت كردن آن ها، از محيط كشت PDB براي ادامه كار استفاده شد. براي شناسايي ايزوله هاي قارچي رشد كرده، استخراج DNA و واكنش زنجيره اي پليمراز با استفاده از آغازگرهاي نواحي فاصله انداز رونويسي شونده داخلي (Internal Transcribed Spacer) انجام شد. نتايج حاصل از PCR، نشان داد كه از 15 ايزوله جداسازي- شده، در 9 ايزوله قطعه ITS تكثير شد. به طوري كه 3 ايزوله در گونه Penicillium sizovae، 3 ايزوله در گونه Alternaria alternate، 2 ايزوله در جنس Penicillium و ايزوله آخر به دليل شباهت كم توالي ITS آن با داده پايگاه، نامگذاري نشد و احتمالا گونه جديدي باشد و نياز به پژوهش هاي تكميلي دارد. تجزيه وتحليل فيلوژنتيك، 4 گونه مورد نظر را در 2 كلاد كاملا متمايز قرار داد، به طوري كه كمترين فاصله ژنتيكي بين 2 گونه Penicillium و بيشترين فاصله نيز بين 2 ايزوله Penicillium sp و Fungal sp وجود دارد. اين بررسي اولين گزارش در ارتباط با قارچ هاي اندوفيت شيرخشت بوده و نشان مي دهد كه اين گونه گياهي ميزبان تعداد و طيف كمي از قارچ هاي اندوفيت است.