عنوان مقاله :
تشخيص لوسمي لنفوسيتي و ميلوئيدي حاد با استفاده از انتخاب ژنهاي موثر ريزآرايه و الگوريتمهاي دادهكاوي
پديد آورندگان :
حاجي اسكندر ، علي رضا دانشگاه آزاد اسلامي واحد كرج - گروه كامپيوتر , خليليان ، مجيد دانشگاه آزاد اسلامي واحد كرج - گروه كامپيوتر , محمدزاده ، جواد دانشگاه آزاد اسلامي واحد كرج - گروه كامپيوتر , نجفي ، علي دانشگاه علوم پزشكي بقيه الله (عج) - مركز تحقيقات بيولوژي مولكولي، پژوهشكده سيستم بيولوژي مسمويت ها
كليدواژه :
استخراج ويژگي , ريزآرايه , سرطان روده , لوكيميا , شبكه عصبي LSTM
چكيده فارسي :
سرطان يكي از مهمترين علتهاي مرگ و مير در جهان است. در بيشتر موارد اگر اين بيماري زودتر شناسايي شود قابل درمان است. يكي از روشهاي تشخيص سرطان استفاده از دادههاي ريزآرايه است كه بر خلاف روش تصويربرداري، اشعههاي مضر براي انسان در آن وجود ندارد. ريزآرايهها داراي ژنهاي بسيار زيادي هستند كه باعث پيچيده و زمانبر شدن تحليل ميشوند بنابراين انتخاب ژنهاي مفيد يكي از گامهاي اساسي در تشخيص اين بيماري است. روش پيشنهادي در اين مقاله داراي دو فاز اصلي است كه فاز اول آن انتخاب ژنهاي مؤثر است. در فاز بعدي، عمل تشخيص بيماري از ژنهاي انتخاب شده توسط فاز اول انجام ميگيرد. در گذشته الگوريتمهاي زيادي مانند Ridge براي اين منظور ارايه شده است كه با توجه به نتايج بهدست آمده از آزمايشها، دقت روش پيشنهادي اين مقاله نسبت به آنها برتري دارد. در اين مقاله از مجموعه داده لوكيميا و سرطان روده بهعنوان ورودي و ارزيابي روش پيشنهادي استفاده شده است. دقت روش پيشنهادي جهت تعيين مكان ژنها و تشخيص نوع سرطان لوكيميا و سرطان روده بهترتيب 97.62% و 92.31% است. نتايج بهدست آمده از اين روش نسبت به ديگر روشهاي موجود از نظر دقت در مجموعه داده لوكيميا 2.38% و در مجموعه داده سرطان روده 5.61% بهبود يافته است؛ همچنين نسبت به آزمايشهاي بيولوژي از دسترسي آسانتر و هزينه كمتري برخوردار است.