عنوان مقاله :
بررسي بيوانفورماتيكي و شناسايي نقش osa-miR164 در پاسخ به تنش غير زيستي در برنج
پديد آورندگان :
قربانزاده ، زهرا سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - پژوهشگاه بيوتكنولوژي كشاورزي , حميد ، رسميه سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - موسسه تحقيقات پنبه كشور , غفاري ، محمدرضا سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - پژوهشگاه بيوتكنولوژي كشاورزي , حسيني سالكده ، قاسم سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - پژوهشگاه بيوتكنولوژي كشاورزي
كليدواژه :
RNA , غير كد كننده , برنج , پاسخ به تنش غير زيستي , miR164
چكيده فارسي :
MicroRNA (miRNA) گروه بزرگي از RNAهاي كوچك و غير‌‌كد‌كننده (~ 22 نوكلئوتيد) هستند كه در تنظيم پسا‌رونويسي بيان ژن به‌‌صورت برش mRNA هدف و يا مهار ترجمه نقش دارند. مطالعات نشان داده‌‌اند كه miRNAها نقش مهمي در افزايش تحمل گياهان به شرايط نامطلوب محيطي دارند. در اين مطالعه خانواده miR164 در برنج (Oryza sativa)، مورد بررسي قرار گرفت. با استفاده از روش‌هاي بيوانفورماتيك، توالي كليه osa-miR164 متعلق به خانواده miR164 برنج تجزيه و تحليل شده، و پروفايل بياني osa-miR164 تحت شرايط تنش‌هاي غير‌زيستي مختلف ارزيابي شد. سپس عناصر تنظيمي سيس بر روي پيشبرهاي ژن osa-miR164 پيش‌بيني شده و به‌طور همزمان ژن‌هاي هدف miR164 و عملكرد آن‌ها شناسايي شد. نتايج اين مطالعه نشان مي‌دهد نقاط حفاظتي زيادي در توالي‌هاي osa-miR164 بالغ وجود دارد كه در توالي‌هاي پيش‌ساز ديده نمي‌شود. بنابراين الگوهاي بياني متفاوت اعضاي خانواده ژني osa-miR164 تحت شرايط تنش و عناصر تنظيمي متعدد سيس موجود در پيشبرهاي ژن osa-miR164 ممكن است توضيحي براي الگوي بياني متنوع osa-miR164 باشد. در اين تحقيق برخي از ژن‌هاي هدف بالقوه osa-miR164 شناسايي و بيان آن‌ها در شرايط تنش‌هاي مختلف مورد تجزيه و تحليل قرار گرفت. در مجموع يافته‌هاي اين پژوهش منبع با ارزشي براي شناسايي و ارزيابي بيشتر ميان كنش بين ژن‌هاي هدف خانواده osa-miR164 در پاسخ به تنش‌هاي غير زيستي فراهم مي‌كند.
