مطالعه پويش كل ژنوم برپايه آناليز مسير مرتبط با صفات رشد در گوسفند

پژوهش حاضر با هدف مطالعه پويش كل ژنوم بر اساس آناليز غني سازي مجموعه‌ هاي ژني براي شناسايي جايگاه ‌هاي ژني مؤثر بر صفات رشد با استفاده از آرايه ‌هاي ژنومي 50K بوده است. بدين منظور از اطلاعات ركورد‌هاي فنوتيپي و ژنوتيپي مرتبط با اوزان تولد (BW)، شيرگيري (WW)، شش ماهگي (6MW) و دوازده ماهگي (12MW) 240 رأس از گوسفند نژاد هوي استفاده شد. ابتدا آناليز پويش كل ژنومي براي صفات رشد در برنامه TASSEL انجام شد. سپس با استفاده از بسته نرم افزاري biomaRt2 برنامه R ژن هاي معني داري كه در داخل و يا 15 كيلوباز بالا و پايين دست نشانگرهاي معني دار قرار داشتند، شناسايي گرديد. در نهايت تفسير مجموعه ژني با بسته نرم افزاري goseq برنامه R با هدف شناسايي عملكرد بيولوژيكي ژن ‌هاي نزديك به مناطق انتخابي و ژن‌ هاي كانديدا از طريق پايگاه‌ هاي GO، KEGG، DAVID و PANTHER انجام شد. با تجزيه و تحليل غني سازي مجموعه هاي ژني، مسيرهاي زيستي و )ژن هاي كانديداي) Regulation of skeletal muscle cell proliferation  وActin filament polymerization  (IGFBP4 و MYOD1) مرتبط با صفت BW، Regulation of anatomical structure morphogenesis،regulation of muscle system process  و cell junction (BMP2، THBS1 و MYH10)،Regulation of skeletal muscle tissue development با صفت WW  و Regulation of anatomical structure size (FGF2، ANGPTL4، TGFBR3 و ACTR3)  با صفت 6MW و Anatomical structure morphogenesis، Positive regulation of ossification و Cellular response to growth factor stimulus (MMP7، ACTA2، EGR1 و MYBPC3) با صفت 12MW شناسايي شدند. مسيرهاي شناسايي شده عملكرد‌هاي مهمي را در ارتباط با رشد و توسعه عضلات اسكلتي، متابوليسم گلوكز، فرآيند استخوان سازي، اندازه بدن، تركيب عضله و تنظيم يون كلسيم بر عهده داشتند. ژن هاي كانديداي گزارش شده در اين پژوهش مي توانند درك روشني از پايه مولكولي مربوط به صفات رشد در گوسفند را ايجاد كنند. نتايج حاصل از اين پژوهش مي تواند ديدگاه جديدي در رابطه با معماري ژنتيكي صفات رشد در برنامه هاي اصلاح نژادي گوسفند ايجاد كند.