عنوان مقاله :
ارزيابي اثرات اصلي و متقابل ژنوتيپ × محيط و برآورد ضرايب همبستگي ارزش‌هاي اصلاحي ژنومي صفات كيفيت نانوايي گندم (T.aestivum L.)
پديد آورندگان :
آرميون ، محمد سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - مركز تحقيقات و آموزش كشاورزي و منابع طبيعي ايلام - بخش تحقيقات علوم زراعي و باغي , بي همتا ، محمد رضا دانشگاه تهران - دانشكده علوم و مهندسي كشاورزي - گروه زراعت و اصلاح نباتات , معالي اميري ، رضا دانشگاه تهران - دانشكده علوم و مهندسي كشاورزي - گروه زراعت و اصلاح نباتات , خدارحمي ، منوچهر سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - موسسه تحقيقات اصلاح و تهيه نهال و بذر , ايسوبه ، ساچيكو موسسه تحقيقات DNA كازوسا ژاپن - آزمايشگاه ژنوميكس و ژنتيك كاربردي گياهي
كليدواژه :
اثرات اصلي و متقابل , روش آماري , ژنوتيپ‌سنجي به روش ddRAD-Seq , ضرايب همبستگي برآورد ارزش اصلاحي ژنومي , گندم نان
چكيده فارسي :
جهت ارزيابي اثرات اصلي و متقابل ژنوتيپ × محيط و برآورد و مقايسه ضرايب همبستگي ارزش‌هاي اصلاحي ژنومي صفات كيفيت نانوايي گندم در يك جمعيت پيشرفته اصلاحي گندم نان، آزمايشي در قالب طرح آلفا لاتيس در سه تكرار با 50 لاين و ارقام شاهد در ايستگاه تحقيقاتي چرداول مركز تحقيقات و آموزش كشاورزي و منابع طبيعي استان ايلام به مدت دو سال اجرا شد. تجزيه واريانس صفات كيفيت نانوايي گندم به صورت ساده و مركب انجام و عامل ژنوتيپ، سال و اثر متقابل ژنوتيپ × سال بر ميزان پروتئين خام، عدد فالينگ، عدد زلني و اندازه حجم رسوب SDS معني‌دار بود. براي برآورد ارزش‌هاي اصلاحي ژنومي از روش ddRAD-Seq و بستر NextSeqTM500Illumina استفاده شد. تعداد كل SNP هاي صحيح فراخوني شده براي 50 درصد داده گم‌شده برابر با 3342 عدد، كه تعداد 1322 بر ژنوم B، 1253 بر ژنوم A و 767 روي ژنوم D و بيشترين SNP بر روي كروموزوم دو و سه از ژنوم B و كمترين آن روي كروموزوم چهار از ژنوم D شناسائي شد. برآورد ضريب همبستگي ارزش اصلاحي ژنومي در سال اول، دوم و متوسط دو سال براي صفات پروتئين خام، عدد فالينگ و عدد زلني با روش‌هاي آماري رگرسيون LASSO و رگرسيون شبكه الاستيك صورت گرفت و براي اندازه حجم رسوب SDS هيچگونه مدلي برازش نشد.
