كاربرد سيستم تايپينگ MLVA 8 لوكوسي بر جدايه‌هاي بوركولدريا مالياي جمع‌آوري شده در ايران از سال 1391 تا 1399، به روزرساني جديد

بوركولدريا مالياي با وجود سال‌هاي طولاني اجراي برنامه‌هاي تست و كشتار توسط كشورهاي منطقه، همچنان تك‌سميان در خاورميانه و خاور دور را آلوده مي‌نمايد. در ايران نيز گزارشات موردي مشمشه و به صورت نادر موارد عفونت انسان مشاهده مي‌گردد. تكنيك لوكوس‌هاي حامل واحدهاي تكرار شونده پلي‌مرف در طول توانايي خود را در افتراق ميان سويه‌هاي بوركولدريا مالياي ثابت نموده است. در مطالعه حاضر يك سيستم تايپينگ مولكولي سويه مشتمل بر 8 لوكوس گزارش مي‌گردد. اين سيستم به صورت آزمايشگاهي بر روي 6 جدايه بومي معرف جديدترين همه‌گيري‌هاي مشمشه در ايران و يك سويه بوركولدريا مالياي اجرا گرديد. علاوه بر اين مجموعه‌اي از ژنوم 20 سويه مرجع بوركولدريا مالياي و 2 سويه بوركولدريا سودومالياي اخذ شده از بانك‌هاي اطلاعاتي Pubmed نيز در مطالعه وارد و به صورت رايانه‌اي مورد ارزيابي قرار گرفتند. آلل‌هاي شناسايي شده از فقط 1 مورد (لوكوس 41) تا 10 مورد (لوكوس 13) متفاوت و مقادير Nei’s diversity index نيز از 0.53 تا 0.89 تعيين گرديد. در مجموع 27 جدايه تحت آزمايش توسط سيستم تايپينگ مورد استفاده در 25 تيپ ژنتيكي و 7 جدايه و سويه ايران در 6 تيپ ژنتيكي دسته‌بندي شدند. نويسندگان معتقدند تا زمان اقتصادي شدن بسترهاي تعيين توالي كامل ژنوم در آزمايشگاه‌هاي با بودجه محدود در كشورهاي در حال توسعه، نسخه‌هاي بهينه MLVA نظير آنچه در اين مطالعه شرح داده شده است، مي‌توانند در پيشبرد تحقيقات همه‌گيرشناسي بوركولدريا مالياي و آشكارسازي ارتباطات ميان جدايه‌هاي آن در مقياس محلي، منطقه‌اي و جهاني به خوبي موثر باشند.