بررسي مسيرهاي متابوليكي مرتبط با جايگاه صفات كمي مربوط به صفت مقاومت به انگل در ژنوم گوسفند با استفاده از رسم شبكه‌ژني و هستي‌شناسي ژن

طي دهه‌هاي اخير، پيشرفت در فن‌آوري نشانگرهاي مبتني بر DNA و در دسترس بودن داده‌هاي ژنومي مانند جايگاه صفات كمي و بررسي كاربرد ژن‌ها از طريق روش‌هاي بيوانفورماتيك نقش مهمي در درك پتانسيل ژنتيكي صفات مختلف داشته است. در اين مطالعه QTL هاي مربوط به صفت مقاومت به انگل در گوسفند از طريق پايگاه داده AnimalQTL تهيه شد. سپس ژن‌هاي مربوط به هر QTL نيز از ژنوم مرجع گوسفند در پايگاه داده NCBI به دست آمد. در ادامه، به‌منظور درك ارتباط بين ژن‌هاي به‌دست‌آمده، شبكه‌هاي ژني براي هر صفت با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape_v3.8.0 ترسيم شد و نهايتاً به‌منظور تفسير شبكه‌هاي ژني و بررسي هستي‌شناسي ژن‌ها از نرم‌افزار Cytoscape استفاده شد. نتايج اين مطالعه نشان داد درمجموع 71 QTL براي صفت مقاومت به انگل وجود دارد كه تحت كنترل 198 ژن مي‌باشند. اكثراً اين نشانگرها با استفاده از روش‌هايي چون مطالعه هم‌خواني سراسر ژنوم (GWAS)، نقشه‌برداري وراثت‌پذيري منطقه‌اي (RHM) و يا با استفاده از چندشكلي‌هاي تك نوكلئوتيدي (SNP) نقشه‌يابي شده بودند. آناليز هستي‌شناسي در اين تحقيق 20 مسير بيولوژيكي را نشان داد كه چهار مسير عمده سهم بيشتري داشتند و شامل: فرآيند متابوليك پيرووات، فرآوري آنتي‌ژن و عرضه آنتي‌ژن پپتيد از طريق مولكول‌هاي اصلي سازگار بافتي كلاس I، مهاجرت سلول‌هاي عصبي و اتصال مولكول چسبندگي سلولي بودند. در اين تحقيق براي اولين بار ژن‌هاي درگير، هستي‌شناسي ژن‌ها، بررسي و يافتن مسيرهاي متابوليكي مرتبط باصفت مقاومت به انگل در گونه گوسفند از طريق داده‌هاي QTL توصيف ‌شد. با استفاده از روش و نتايج اين تحقيق مي‌توان ژن‌ها و نيز هستي‌شناسي را براي صفات مهم و اقتصادي در گوسفند و حتي ساير حيوانات اهلي مشخص و ارزيابي كرد.