همسانه‌سازي و بررسي تبارزايي جدايه‌هاي ايراني narcissus latent virus براساس ترادف نوكلئوتيدي ناحيه ’3 ژنوم

ويروس نهفته نرگس (narcissus latent virus, NLV) يكي از بيمارگرهاي بسيار مهم و خسارت زاي ارقام تجاري گياه نرگس و زنبق در سراسر جهان مي باشد. به منظور شناسايي اين ويروس، گياهان زنبق با علائم مشكوك ويروسي از شمال شرق كشور جمع‌آوري و ناحيه ´3 ژنوم آنها با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي با روش رونويسي معكوس و واكنش زنجيره اي پلي مراز (RT-PCR) تكثير و همسانه سازي شد. ناحيه CP-UTR اين جدايه ها (سه جدايه) به همراه تعدادي از ترادف هاي جدايه هاي موجود در بانك ژن (24 جدايه) مقايسه و پس از انجام همرديف سازي چندگانه، مورد تجزيه و تحليل فيلوژنتيكي قرار گرفتند. جدايه هاي مورد مقايسه در درخت فيلوژنتيكي در دو گروه جداگانه قرار گرفتند ( I وII ) و جدايه هاي ايراني در كنار جدايه هايي از لهستان، نيوزيلند، و بريتانيا در گروه II قرار گرفتند. مقايسه درصد مشابهت ژنتيكي نشان داد كه جدايه هاي ايراني با ساير جدايه هاي NLV بين 77.47 تا 98.12 درصد در سطح نوكلئوتيدي مشابهت دارند كه به ترتيب بيشترين ميزان شباهت (بين 97.65 تا 98.12 درصد) با جدايه NLV5_1 (JX270766) از لهستان و كمترين (بين 77.47 تا 77.95 درصد) با جدايه NLV3 (JX270762) از لهستان بود. همچنين تشابه توالي نوكلئوتيدي و آمينواسيدي سه جدايه ايراني با يكديگر به ترتيب 97.84-97 و 99.02-97.38 درصد تعيين گرديد. ميزان تنوع نوكلئوتيدي ناحيه CP-UTR  بين جدايه هاي NLV، 0.130 به دست آمد كه نشان دهنده تنوع ژنتيكي بالاي اين ويروس در اين ناحيه از ژنوم است. نتايج پژوهش حاضر مي تواند در برنامه هاي به نژادي مولكولي براي توليد ارقام مقاوم به ويروس مفيد بوده و خسارت ناشي از بيماري را كاهش دهد.