مطالعه پويش ژنومي و آناليز مسيرهاي زيستي براي شناسايي ژن‌هاي موثر بر رنگ پوشش در ‏گوسفندان لري-بختياري

رنگ پوشش، يكي از صفات مهم اقتصادي در گوسفند بوده و همچنين مي‌تواند در شناسايي و تعيين خصوصيات نژادي مورد استفاده قرار گيرد. هدف پژوهش حاضر، مطالعه پويش كل ژنوم و آناليز مسيرهاي زيستي بر مبناي تجزيه و تحليل غني سازي مجموعه ژني جهت شناسايي جايگاه ها و ژن‌هاي مرتبط با صفت رنگ پوشش گوسفندان لري-بختياري بوده است. پويش كل ژنوم بر اساس روش مورد-شاهدي در برنامه PLINK نسخه 1.90 انجام شد. آناليز غني سازي مجموعه ژني با بسته نرم افزاري goseq برنامه R نسخه 6.1/3 با هدف شناسايي سطوح عملكردي و مسيرهاي زيستي ژن‌هاي نزديك در مناطق انتخابي كانديدا انجام شد و در نهايت براي آناليز بيوانفورماتيكي از پايگاه هاي برخط GO، Metacyc، KEGG، Reactome و Panther استفاده گرديد. در اين پژوهش نشانگر تك نوكلئوتيدي معني دار روي كروموزوم هاي 1، 2، 6، 9، 10 و 16 شناسايي شدند كه با ژن‌هاي EDNRB، PDGFRA، TCF25 و TYRP1 مرتبط بودند. در آناليز غني سازي مجموعه ژني تعداد 5 مسير هستي شناسي ژني با صفت رنگ پوشش مرتبط بودند (0.05P lt;). از اين بين، مسيرهاي Regulation of protein tyrosine kinase activity، Regulation of protein kinase A signaling وActivation of protein kinase activity نقش مهمي در رشد و توسعه ملانوسيت ها و تنظيم رنگدانه ها در بدن داشتند. با توجه به تأييد ارتباط برخي از مناطق ژنومي شناسايي شده در تحقيق حاضر با رنگ پوشش در گوسفند و بعضي گونه هاي ديگر و همچنين شناسايي مناطق ژنومي جديد، ژن‌هاي شناسايي شده در اين مطالعه مي توانند به عنوان ژن‌هاي كانديدا براي مطالعات تكميلي و نهايتا در انتخاب ژنتيكي رنگ پوشش در گوسفند مورد استفاده قرار گيرد.