بررسي ايمونوانفورماتيك ‌ليزين‌هاي كدشده در باكتريوفاژهاي موثر بر باكتري‌هاي جنس سودوموناس

گونه‌هاي باكتري متعلق به جنس سودوموناس از جمله باكتري‌هاي فرصت‌طلب بيماريزا هستند كه بيشترين عامل عفونت‌هاي بيمارستاني را شامل مي‌شود. با توجه به افزايش مقاومت اين گروه از باكتري‌ها در برابر اكثر آنتي‌بيوتيك‌ها، فاژدرماني و يا استفاده از ليزين فاژ يكي از جايگزين‌‌‌‌هاي درمان است. شناسايي خانواده‌ي باكتريوفاژ‌ موثر بر سودوموناس و ارزيابي مقدار ايمني‌زايي ليزين ضد ميكروبي اين نوع فاژها مي‌باشد. در اين تحقيق، با استفاده از پايگاه‌هاي داده بيوانفورماتيك و ايمنوانفورماتيك، ويژگي‌هاي فيزيكوشيميايي خانواده‌هاي مختلف از فاژهاي ليتيك موثر بر جنس سودوموناس، ساختار دوم وسوم ليزين‌هاي‌ فاژ و ميزان القاي پاسخ ايمني سلولي و هومورال ميزبان، مورد مطالعه قرار گرفته است در بين خانواده‌هاي باكتريوفاژ موثر بر باكتري‌هاي از جنس سودوموناس، سه خانواده سيفوويريده، ميووريده، پودوويريده با جمعيت بيش از ۹۰ درصد، بيشترين فراواني را نشان داد. همچنين توالي آمينواسيدي اندوليزين هريك از اين سه خانواده، تنها در نيمي از كل اسيد آمينه‌ها با امتياز برابر نصف حدآستانه نرم افزار، داراي خاصيت انتي‌ژني براي سلول‌هاي لنفوسيت B و تنها در ۱ درصد اسيد آمينه‌ها داراي ميل اتصال قوي به مولكول‌هاي حامل MHC براي ارايه به سلول‌هاي T بودند. هيچ يك از ليزين‌هاي مورد مطالعه خاصيت انتي‌ژني ندارند. با توجه به نتايج بدست آمده از مقدار ايمني‌زايي پروتئين‌‌هاي ليزين فاژ، آنها مي‌توانند جايگزين آنتي‌بيوتيك باشند.